90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2080 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2080  hydrolase  100 
 
 
208 aa  418  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0798472 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1830  hydrolase  77.29 
 
 
208 aa  337  5e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.797395  hitchhiker  0.00000000137231 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1288  hydrolase  76.81 
 
 
208 aa  325  2.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1016  phosphoserine phosphatase  75.25 
 
 
212 aa  318  3e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1212  phosphoserine phosphatase-like hydrolase  30.48 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0825  phosphoserine phosphatase-like hydrolase  28.64 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0827  phosphoserine phosphatase-like hydrolase  28.33 
 
 
224 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  32.73 
 
 
408 aa  58.2  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  29.17 
 
 
406 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  26.78 
 
 
400 aa  55.1  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  29.76 
 
 
438 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  29.87 
 
 
404 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  29.08 
 
 
398 aa  51.6  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  29.87 
 
 
429 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  26.57 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226172  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1886  phosphoserine phosphatase SerB  27.27 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  28.99 
 
 
410 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  29.5 
 
 
404 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  29.58 
 
 
404 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1367  3-phosphoserine phosphatase  24.86 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  29.09 
 
 
398 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  29.5 
 
 
404 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  29.09 
 
 
404 aa  48.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  35.16 
 
 
306 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  35.16 
 
 
306 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  29.5 
 
 
404 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  28.07 
 
 
412 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  28.92 
 
 
281 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  33.33 
 
 
298 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  29.5 
 
 
415 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  31.21 
 
 
413 aa  46.6  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  29.6 
 
 
309 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  27.92 
 
 
429 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0222  phosphoserine phosphatase SerB  29.66 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0070  phosphoserine phosphatase SerB  31.47 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  31.72 
 
 
307 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  28.17 
 
 
418 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  28.78 
 
 
418 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  30.54 
 
 
279 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  31.72 
 
 
284 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  27.98 
 
 
410 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  30.77 
 
 
298 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  26.71 
 
 
325 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0153  3-deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate phosphatase  38.98 
 
 
181 aa  45.1  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  28.67 
 
 
237 aa  44.7  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  31.16 
 
 
291 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  30.97 
 
 
409 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  30.77 
 
 
298 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  31.25 
 
 
411 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  31.17 
 
 
400 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  28.4 
 
 
299 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.23 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  32.48 
 
 
291 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  26.8 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4784  3-deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate phosphatase  39.62 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  31.17 
 
 
400 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  29.52 
 
 
279 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  25.48 
 
 
325 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  31.97 
 
 
404 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  28.19 
 
 
237 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  27.37 
 
 
289 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  28.49 
 
 
299 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  27.37 
 
 
289 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  32.12 
 
 
406 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  29.31 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  27.65 
 
 
410 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1094  phosphoserine phosphatase  28.29 
 
 
230 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  25.9 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  27.98 
 
 
405 aa  42.4  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  27.98 
 
 
405 aa  42.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  23.39 
 
 
276 aa  42.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  26.06 
 
 
404 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  27.54 
 
 
405 aa  42.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  30.43 
 
 
291 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  29.25 
 
 
435 aa  42  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  31.62 
 
 
291 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  31.1 
 
 
411 aa  42  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  31.08 
 
 
279 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0630  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.86 
 
 
287 aa  42  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  32.41 
 
 
279 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2616  HAD family hydrolase  33.71 
 
 
199 aa  42  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  32.19 
 
 
281 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 
298 aa  41.6  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  31.85 
 
 
295 aa  41.6  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  30.41 
 
 
281 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  30.41 
 
 
281 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  29.7 
 
 
407 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  30.41 
 
 
281 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  30.41 
 
 
281 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  30.41 
 
 
281 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>