More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1665 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  75.12 
 
 		 217 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  72.22 
 
 		 217 aa  308  4e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  75.58 
 
 		 217 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  44.44 
 
 		 226 aa  187  7e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  42.15 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  42.01 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  38.81 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  41.87 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  37.38 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  37.5 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  35.84 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  38.35 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  35.75 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  37.86 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  37.37 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  40.76 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  33.73 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  36.89 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  38.33 
 
 		 229 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  37.63 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  33.87 
 
 		 224 aa  104  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  35.71 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  33.5 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  35.27 
 
 		 230 aa  101  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  34.82 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  33.48 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  34.69 
 
 		 239 aa  93.2  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  34.48 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  33.67 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  30.11 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  32.99 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  29.17 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  32.12 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  29.17 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  29.17 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  29.17 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  29.17 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  29.17 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  28.88 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  29.17 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  29.17 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  28.45 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  29.17 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  29.17 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  29.17 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  29.17 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  29.17 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  29.17 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  27.96 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  28.7 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  30.09 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  28.15 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  30.09 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0444  uridylate kinase  30.13 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.014483  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  28.97 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  30.29 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  28.24 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  27.78 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  29.58 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  30.13 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  28.97 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  29.91 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  29.44 
 
 		 258 aa  74.7  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  28.97 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  30.28 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  29.35 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  29.05 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  31.34 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  31.34 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  32.16 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  28.57 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  28.45 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  28.28 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  30 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  30.88 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  29.27 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1417  uridylate kinase  29.17 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  28.24 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  30.81 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  29.58 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  27.59 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  29.47 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  27.14 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  29.29 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  29.41 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  26.27 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  29.33 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  28.75 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  32.12 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  30.51 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  29.11 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1386  uridylate kinase  29.17 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  27.92 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  27.62 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  26.67 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  27.8 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  27.64 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  27.94 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  28.57 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>