More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1436 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1436  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 476 aa  967    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37868  decreased coverage  0.00181566 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1195  radical SAM domain-containing protein  68.7 
 
 		 478 aa  665    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1897  radical SAM domain-containing protein  65.97 
 
 		 483 aa  675    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.487619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0304  radical SAM domain-containing protein  67.65 
 
 		 483 aa  654    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0457  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 519 aa  232  9e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.211287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 849 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  32.09 
 
 		 544 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  31.45 
 
 		 510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  30.71 
 
 		 559 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 551 aa  190  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  31.16 
 
 		 544 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  31 
 
 		 842 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31 
 
 		 528 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  30.55 
 
 		 613 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  28.39 
 
 		 626 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 		 812 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  28.23 
 
 		 613 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 828 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 599 aa  179  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.48 
 
 		 546 aa  178  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 599 aa  178  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 589 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 589 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  28.88 
 
 		 589 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  30.64 
 
 		 566 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  31.37 
 
 		 593 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 828 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  29.11 
 
 		 544 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 		 557 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 618 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  29.43 
 
 		 842 aa  169  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  29.96 
 
 		 557 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 		 826 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  28.98 
 
 		 540 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 897 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  27.58 
 
 		 836 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 		 557 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 600 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 817 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 591 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 619 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  27.8 
 
 		 613 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 		 898 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 828 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 898 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 597 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 600 aa  163  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0161  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 469 aa  162  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 614 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  27.05 
 
 		 638 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 657 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 856 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.89 
 
 		 860 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 857 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 624 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 617 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 543 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  29.2 
 
 		 898 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 538 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 		 537 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  29.94 
 
 		 573 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  27.77 
 
 		 636 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3787  Radical SAM domain protein  32.42 
 
 		 525 aa  156  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182556  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 860 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  27.88 
 
 		 910 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  28.25 
 
 		 532 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 617 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 617 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  27.74 
 
 		 971 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2298  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.69 
 
 		 465 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1544  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  27.95 
 
 		 882 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  25.6 
 
 		 879 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 619 aa  151  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.62 
 
 		 872 aa  151  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0375  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 438 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0386229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 		 874 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 655 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 640 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0878  Radical SAM domain protein  30.75 
 
 		 509 aa  150  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000778999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  28.6 
 
 		 553 aa  150  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 611 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 		 645 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 627 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 626 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 628 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  27.65 
 
 		 663 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 642 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0461  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 		 852 aa  147  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  26.34 
 
 		 626 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000171239 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.09 
 
 		 887 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 864 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.66 
 
 		 644 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  27.4 
 
 		 626 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>