More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2313 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_256  UvrD/REP helicase  49.28 
 
 		 972 aa  941    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000753871  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2313  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 984 aa  2039    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0207  UvrD/REP helicase  47.85 
 
 		 970 aa  904    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.00182272  decreased coverage  0.0000000525372 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1666  UvrD/REP helicase  29.44 
 
 		 921 aa  377  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.921097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1482  UvrD/REP helicase  29.03 
 
 		 911 aa  312  2e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0495505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  29.1 
 
 		 920 aa  311  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0930  UvrD/REP helicase  27.75 
 
 		 932 aa  261  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0490168  normal  0.240502 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.14 
 
 		 759 aa  181  7e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.72 
 
 		 757 aa  180  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.37 
 
 		 755 aa  180  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  26.26 
 
 		 669 aa  177  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6683  UvrD/REP helicase  25.17 
 
 		 966 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0759039  normal  0.87543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 682 aa  175  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.76 
 
 		 729 aa  174  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 731 aa  174  9e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  27.07 
 
 		 680 aa  173  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.42 
 
 		 729 aa  173  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  27.63 
 
 		 789 aa  172  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.23 
 
 		 671 aa  173  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  27.27 
 
 		 678 aa  170  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.88 
 
 		 732 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  26.79 
 
 		 770 aa  168  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.25 
 
 		 730 aa  167  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  23.07 
 
 		 946 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  27 
 
 		 757 aa  167  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.25 
 
 		 730 aa  167  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  23.07 
 
 		 946 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  25.5 
 
 		 755 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.92 
 
 		 768 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1357  UvrD/REP helicase  27.84 
 
 		 526 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.981315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  27.41 
 
 		 735 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  26.96 
 
 		 678 aa  165  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.06 
 
 		 758 aa  165  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  26.36 
 
 		 735 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.4 
 
 		 833 aa  164  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  26.58 
 
 		 666 aa  164  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.43 
 
 		 785 aa  164  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.71 
 
 		 751 aa  164  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.74 
 
 		 762 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.85 
 
 		 751 aa  162  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 742 aa  162  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.89 
 
 		 1023 aa  162  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.12 
 
 		 858 aa  162  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  25.47 
 
 		 671 aa  162  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  27.54 
 
 		 765 aa  161  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  25.51 
 
 		 773 aa  161  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.48 
 
 		 734 aa  161  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  25.33 
 
 		 671 aa  160  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.31 
 
 		 851 aa  160  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  26.79 
 
 		 743 aa  159  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 787 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.69 
 
 		 781 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  25.46 
 
 		 749 aa  160  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.39 
 
 		 772 aa  159  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.32 
 
 		 662 aa  159  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  26.5 
 
 		 758 aa  159  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 1019 aa  159  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  26.17 
 
 		 668 aa  159  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  27.81 
 
 		 816 aa  159  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  27.26 
 
 		 736 aa  158  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  25.5 
 
 		 678 aa  158  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  26.84 
 
 		 762 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.27 
 
 		 794 aa  158  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  25.5 
 
 		 688 aa  158  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  25.33 
 
 		 723 aa  158  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  28.09 
 
 		 634 aa  157  7e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  26.98 
 
 		 707 aa  157  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  26.61 
 
 		 739 aa  157  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 741 aa  157  8e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  26.36 
 
 		 724 aa  157  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.06 
 
 		 715 aa  157  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0352  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 709 aa  157  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.877458  normal  0.0118212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  26.17 
 
 		 742 aa  157  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.95 
 
 		 739 aa  156  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.45 
 
 		 725 aa  156  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.91 
 
 		 725 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  26.84 
 
 		 779 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.29 
 
 		 773 aa  155  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.72 
 
 		 766 aa  155  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.73 
 
 		 751 aa  155  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  25.18 
 
 		 778 aa  154  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  25.82 
 
 		 724 aa  154  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  26.5 
 
 		 672 aa  154  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.9 
 
 		 756 aa  154  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  26 
 
 		 616 aa  154  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  26.84 
 
 		 678 aa  154  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 		 812 aa  153  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.33 
 
 		 806 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.19 
 
 		 747 aa  154  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  24.89 
 
 		 746 aa  153  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  27.11 
 
 		 726 aa  152  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.26 
 
 		 747 aa  153  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.18 
 
 		 751 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  26.18 
 
 		 753 aa  153  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  26.54 
 
 		 751 aa  153  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 744 aa  153  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.18 
 
 		 747 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.18 
 
 		 751 aa  153  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  25.73 
 
 		 696 aa  152  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4281  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 		 716 aa  152  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344477  normal  0.133481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>