More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4240 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4240  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 260 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3974  ABC transporter  93.85 
 
 		 260 aa  497  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1341  ABC transporter-like  87.65 
 
 		 262 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1364  ABC transporter related  80.99 
 
 		 289 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.245091  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2684  ABC transporter related protein  77.96 
 
 		 263 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2397  ABC transporter related  77.55 
 
 		 268 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3976  ABC transporter related  71.98 
 
 		 257 aa  363  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2358  ABC transporter related  68.75 
 
 		 246 aa  323  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.869822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0048  ABC transporter related  59.52 
 
 		 259 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1124  ABC transporter  61.66 
 
 		 267 aa  316  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4452  ABC transporter related  60.92 
 
 		 253 aa  298  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6108  ABC transporter related  59.6 
 
 		 276 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.665492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1591  ABC transporter related  60.66 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.963081  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2185  ABC transporter related  57.31 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.839848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2603  ABC transporter related  58.13 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0742  putative ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6520  ABC transporter related  60.08 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.510638 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2499  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.87 
 
 		 279 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1889  ABC transporter related  59.15 
 
 		 257 aa  289  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4534  ABC transporter related  56.15 
 
 		 263 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2730  ABC transporter related  62.96 
 
 		 280 aa  286  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1225  ABC transporter related  55.56 
 
 		 274 aa  282  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0610  ABC transporter related  59.23 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3490  ABC transporter related  50.6 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  43.78 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  41.53 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.41 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45 
 
 		 393 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  44.08 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.47 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.47 
 
 		 364 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3104  ABC transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 		 361 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  42 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.47 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1216  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding subunit  41.01 
 
 		 361 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  43.18 
 
 		 384 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  41.02 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4886  ABC transporter related  43.09 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188443  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.13 
 
 		 370 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.55 
 
 		 393 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 		 355 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  41.22 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.33 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  41.84 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  41.8 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.93 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  45.13 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  44.39 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  45.32 
 
 		 358 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  43.06 
 
 		 359 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2235  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.94 
 
 		 364 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  41.2 
 
 		 369 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  41.2 
 
 		 368 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  41.2 
 
 		 368 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  44.59 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  41.2 
 
 		 369 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2547  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.94 
 
 		 364 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  47.45 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  45.34 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2473  ABC transporter related  43.17 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.01 
 
 		 370 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.01 
 
 		 370 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.01 
 
 		 370 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.28 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.01 
 
 		 370 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.01 
 
 		 370 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.25 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  44.13 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.92 
 
 		 395 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.12 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.01 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  41.2 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  38.89 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  40.74 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  40.74 
 
 		 369 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  43.19 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.07 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.72 
 
 		 373 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0202  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 		 351 aa  170  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  43.46 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.63 
 
 		 327 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.05 
 
 		 668 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  42.59 
 
 		 329 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  42.59 
 
 		 329 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  45.5 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41 
 
 		 329 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.06 
 
 		 330 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  41.67 
 
 		 387 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 370 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  45.96 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  43.26 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.55 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  44.16 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  39.84 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>