More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3120 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  90.3 
 
 		 269 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  62.13 
 
 		 269 aa  308  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  40.98 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  42.8 
 
 		 270 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  43.89 
 
 		 270 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  42.22 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  41.29 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  41.44 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  37.92 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  40.53 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  39.7 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3771  Cof-like hydrolase  39.85 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  41.38 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  41.6 
 
 		 267 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  43.89 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  41.44 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6359  Cof-like hydrolase  41.83 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  41.44 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2813  Cof protein  35 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  32.21 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  30.4 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  28.47 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.6 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  29.12 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  30.18 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  30.14 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  29.2 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  29.48 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  28.32 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  29.01 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  29.96 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  31.2 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  27.99 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  27.17 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  26.15 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  26.14 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  28.04 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  30.74 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  30.3 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  29.15 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  27.55 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.18 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  26.13 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  27.55 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.13 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  26.13 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  26.13 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  26.13 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5042  Cof-like hydrolase  27.38 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.555444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  25.78 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  26.79 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.48 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  32.82 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  26.3 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  30.65 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  25.94 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 		 273 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  26.16 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  27.34 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.18 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  25.56 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  25.66 
 
 		 262 aa  99  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  27.74 
 
 		 271 aa  98.6  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  29.91 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0700  putative HAD superfamily hydrolase  26.1 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4042  Cof-like hydrolase  31.02 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  26.22 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  29.36 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  26.22 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  27.72 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 277 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  28 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  27.7 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  26.36 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  29.04 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  28.52 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0783  HAD superfamily hydrolase  28.01 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  31.28 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  31.28 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  28.52 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  31.28 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  31.28 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  26.25 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4408  putative conserved hypothetical protein  29.64 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.45 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  30.29 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  25.8 
 
 		 461 aa  93.2  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>