More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1553 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  90.5 
 
 		 401 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1553  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 400 aa  781    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1169  acetyl-CoA acetyltransferase  60.75 
 
 		 400 aa  502  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178123 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1236  acetyl-CoA acetyltransferase  60.25 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.439957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.86 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.86 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.61 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.61 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.61 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  56.47 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.57 
 
 		 401 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.24 
 
 		 412 aa  401  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.61 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.62 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.22 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.22 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.71 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.85 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.32 
 
 		 401 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  57.21 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.37 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.96 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.09 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.88 
 
 		 401 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.63 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.14 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 		 398 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.22 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1034  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.71 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0157191  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.69 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.21 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.22 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.37 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.21 
 
 		 400 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.27 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  51.99 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.21 
 
 		 405 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3594  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.74 
 
 		 409 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.48 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.21 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.21 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.21 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.49 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.21 
 
 		 405 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.21 
 
 		 405 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.21 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.21 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.21 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  51.87 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.21 
 
 		 405 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.21 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.73 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  52.37 
 
 		 398 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.22 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.62 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1198  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.61 
 
 		 401 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3081  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.86 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.426252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.02 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.74 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.87 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.86 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.22 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  46.52 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.39 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.25 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.5 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.61 
 
 		 402 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.73 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.94 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.48 
 
 		 400 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.97 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.12 
 
 		 397 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.22 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.97 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.37 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.23 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3817  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.82 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342628  normal  0.265145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.48 
 
 		 402 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  52.12 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.49 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.23 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  49.88 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.6 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2833  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.12 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.6 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.35 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.23 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.87 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.88 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.12 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.23 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.37 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.99 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.48 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>