More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3818 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 435 aa  860    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  90.19 
 
 		 435 aa  731    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  84.96 
 
 		 435 aa  710    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  94.72 
 
 		 435 aa  760    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  54.48 
 
 		 451 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  55.3 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  56.08 
 
 		 465 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  55.69 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  54.67 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  57.49 
 
 		 428 aa  458  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  56.64 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  45.17 
 
 		 482 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  43 
 
 		 562 aa  315  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  44.26 
 
 		 558 aa  306  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  41.35 
 
 		 734 aa  289  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  39.43 
 
 		 519 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  26.72 
 
 		 585 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  29.98 
 
 		 517 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  29.68 
 
 		 513 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  30.23 
 
 		 268 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  33.55 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  31.84 
 
 		 270 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  32.89 
 
 		 271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  29.08 
 
 		 499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  29.51 
 
 		 284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  32.74 
 
 		 281 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  33.05 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  33.81 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  31.84 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  31.28 
 
 		 281 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  31.84 
 
 		 272 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  33.56 
 
 		 558 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  32.89 
 
 		 281 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  31.75 
 
 		 301 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  31.84 
 
 		 272 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  31.58 
 
 		 276 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  31.17 
 
 		 270 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  31.46 
 
 		 272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  32.74 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  30.67 
 
 		 272 aa  111  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  31.62 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  29.37 
 
 		 512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  31.74 
 
 		 284 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  26 
 
 		 290 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  30.61 
 
 		 264 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  27.75 
 
 		 271 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  31.28 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  26.23 
 
 		 272 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  31.36 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.51 
 
 		 325 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  29.72 
 
 		 302 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  28.76 
 
 		 290 aa  107  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  22.83 
 
 		 273 aa  106  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  30.26 
 
 		 272 aa  106  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  31.54 
 
 		 323 aa  106  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  30.77 
 
 		 278 aa  106  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.38 
 
 		 285 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  33.18 
 
 		 278 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  32.38 
 
 		 284 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  32.03 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.06 
 
 		 278 aa  103  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  27.92 
 
 		 274 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  30.52 
 
 		 274 aa  103  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  32.1 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  31.22 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  30.17 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  30 
 
 		 274 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  29.39 
 
 		 281 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  30.41 
 
 		 273 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  32 
 
 		 277 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  30.77 
 
 		 267 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  30.29 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  29.75 
 
 		 323 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  32.09 
 
 		 280 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  29.75 
 
 		 323 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  29.75 
 
 		 323 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  29.75 
 
 		 323 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  30.29 
 
 		 323 aa  99.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1170  OmpA family protein  31.63 
 
 		 512 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  29.08 
 
 		 285 aa  99.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  29.75 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  30.17 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.78 
 
 		 277 aa  98.2  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  29.75 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  29.75 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  29.96 
 
 		 323 aa  97.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  32.41 
 
 		 330 aa  97.1  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  30.3 
 
 		 330 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  30.48 
 
 		 270 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  28.63 
 
 		 285 aa  97.1  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.63 
 
 		 272 aa  97.1  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.03 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  31.25 
 
 		 279 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.75 
 
 		 218 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  30.17 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  29.02 
 
 		 272 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13780  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.39 
 
 		 331 aa  94.4  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0228402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  29.88 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>