More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2594 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 313 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  66.67 
 
 		 313 aa  414  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  63.34 
 
 		 313 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  62.7 
 
 		 313 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  62.7 
 
 		 313 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  60.06 
 
 		 314 aa  381  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  42.42 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  42.42 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  46.64 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  41.88 
 
 		 312 aa  258  9e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  45.3 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  45.07 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  41.61 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  45.3 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  45.3 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  40.68 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  39.87 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  43.92 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  39.16 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  39.16 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  40.53 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  40.28 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  38.74 
 
 		 324 aa  235  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  44.59 
 
 		 336 aa  235  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  45.79 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  44.37 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  43.1 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  44.07 
 
 		 352 aa  229  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  43.01 
 
 		 331 aa  228  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  40.19 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  40.19 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  40 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  40.21 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  39.5 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  39.93 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  40.21 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  40.96 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  39.93 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  43.17 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  39.93 
 
 		 338 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  40.96 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  40.29 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  42.91 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  44.44 
 
 		 344 aa  215  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  38.08 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  49.43 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  40.96 
 
 		 336 aa  212  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  38.08 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  41.67 
 
 		 352 aa  210  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  44.18 
 
 		 328 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  43.45 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  37.58 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.66 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  48.35 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  35.18 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  42.8 
 
 		 319 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  39.74 
 
 		 319 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  48.05 
 
 		 274 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  40.59 
 
 		 332 aa  195  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  41.6 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  32.33 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  28.48 
 
 		 336 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  30.96 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.45 
 
 		 694 aa  106  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  31.77 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  33.9 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  33.9 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  33.9 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  27.95 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  30.59 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  27.33 
 
 		 348 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  31.49 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003687  vitamin B12 ABC transporter permease component BtuC  30.94 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  31.05 
 
 		 354 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  26.85 
 
 		 335 aa  99  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  32.86 
 
 		 358 aa  99  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  27.01 
 
 		 348 aa  99  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  33.21 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  31.69 
 
 		 370 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  30.1 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  27.48 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  27.48 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  27.48 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  27.48 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  30.93 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  29.39 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  27.01 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  27.15 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  32.49 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  27.15 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  26.82 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  26.82 
 
 		 351 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  27.12 
 
 		 350 aa  95.9  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  27.24 
 
 		 335 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1136  FecCD transport family protein  30.74 
 
 		 322 aa  95.9  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500551  normal  0.214464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  33.77 
 
 		 334 aa  95.9  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>