More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2564 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  100 
 
 		 232 aa  473  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  98.71 
 
 		 232 aa  470  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  99.14 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  93.53 
 
 		 232 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  79.31 
 
 		 231 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  71.55 
 
 		 232 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  71.12 
 
 		 232 aa  351  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  70.26 
 
 		 232 aa  349  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  71.55 
 
 		 238 aa  342  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  69.4 
 
 		 233 aa  334  5.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  69.1 
 
 		 234 aa  330  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  67.67 
 
 		 232 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  67.24 
 
 		 232 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  66.81 
 
 		 232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  67.67 
 
 		 232 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  67.24 
 
 		 233 aa  324  9e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  65.8 
 
 		 243 aa  323  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  66.81 
 
 		 233 aa  322  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  65.52 
 
 		 232 aa  322  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  66.38 
 
 		 232 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  66.81 
 
 		 232 aa  318  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  65.52 
 
 		 232 aa  317  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  63.04 
 
 		 232 aa  291  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  58.19 
 
 		 236 aa  267  8e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  56.41 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  54.27 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  49.35 
 
 		 232 aa  214  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  47.84 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  47.84 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  47.84 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  47.41 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  47.41 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  44.07 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  43.29 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  41.73 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  46.98 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  46.98 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  47.41 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  45.69 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  46.98 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  46.98 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  46.98 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  46.98 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  46.98 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  46.98 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  46.98 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  46.98 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  46.55 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  46.55 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  47.41 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  44.4 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  48.28 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4606  pirin domain-containing protein  45.06 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  44.21 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  44.21 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  46.12 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4023  YhhW family protein  46.58 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4103  hypothetical protein  46.58 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0133  pirin domain-containing protein  46.58 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  43.35 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5189  hypothetical protein  43.29 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  43.05 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  45.49 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  43.4 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  45.06 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4046  pirin domain-containing protein  44.4 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600908  normal  0.055577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5153  hypothetical protein  43.53 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000262926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0060  hypothetical protein  43.53 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225741  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  45.06 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4908  hypothetical protein  44.44 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5283  hypothetical protein  44.44 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  42.42 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5184  hypothetical protein  43.53 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.930395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4772  pirin  44.44 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  42.49 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  42.67 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  44.83 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  42.49 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4753  pirin  44.44 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  42.41 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1546  hypothetical protein  41.63 
 
 		 229 aa  189  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.105778  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  41.38 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1852  Pirin-like  43.35 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  41.81 
 
 		 236 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  42.06 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  44.64 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  42.24 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2901  Pirin-like  43.35 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278397  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  42.49 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5198  hypothetical protein  42.67 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.312315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4422  Pirin-like  41.96 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1735  pirin domain-containing protein  43.91 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0725  pirin domain-containing protein  39.91 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  42.13 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1845  pirin domain-containing protein  39.73 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  42.06 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  40.95 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0430  Pirin domain protein  42.13 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  40.09 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2406  Pirin domain protein  39.66 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>