225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1224 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0538  hypothetical protein  66.85 
 
 
564 aa  801    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1455  hypothetical protein  57.85 
 
 
566 aa  709    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1516  hypothetical protein  61.62 
 
 
557 aa  749    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0533389  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1224  hypothetical protein  100 
 
 
567 aa  1182    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2445  hypothetical protein  58.77 
 
 
567 aa  707    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13031  hypothetical protein  94.18 
 
 
567 aa  1113    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1849  hypothetical protein  55.75 
 
 
586 aa  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01523  hypothetical protein  57.12 
 
 
567 aa  689    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12961  hypothetical protein  97.18 
 
 
567 aa  1136    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.646807  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12881  hypothetical protein  76.19 
 
 
567 aa  929    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.446292  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12841  hypothetical protein  66.67 
 
 
564 aa  807    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.411395  normal  0.708287 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05771  hypothetical protein  60.67 
 
 
567 aa  756    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.90155 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06141  hypothetical protein  64.37 
 
 
567 aa  796    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42069  predicted protein  40.31 
 
 
594 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313967  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29423  predicted protein  37.68 
 
 
669 aa  376  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929272  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22659  predicted protein  37.66 
 
 
638 aa  359  9e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6099  protein of unknown function UPF0061  31.57 
 
 
548 aa  250  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120192  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2639  hypothetical protein  31.84 
 
 
524 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1627  hypothetical protein  32.19 
 
 
521 aa  242  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248376  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1788  hypothetical protein  33.03 
 
 
518 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00396  hypothetical protein  32.7 
 
 
518 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2062  hypothetical protein  31.68 
 
 
533 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.413153  normal  0.465678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2147  hypothetical protein  31.89 
 
 
515 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354492  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2793  hypothetical protein  31.28 
 
 
522 aa  221  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  30.68 
 
 
504 aa  220  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  31.86 
 
 
499 aa  216  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  29.85 
 
 
518 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  30.61 
 
 
505 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1589  hypothetical protein  29.96 
 
 
521 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510421  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1510  hypothetical protein  31.29 
 
 
565 aa  209  8e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  31.55 
 
 
494 aa  209  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  29.76 
 
 
522 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  29.76 
 
 
522 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  31.93 
 
 
488 aa  209  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2185  hypothetical protein  32.06 
 
 
525 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  29.68 
 
 
495 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  30.66 
 
 
492 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  29.57 
 
 
522 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  29.7 
 
 
522 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  29.92 
 
 
522 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  29.47 
 
 
518 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  29.51 
 
 
540 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  29.73 
 
 
522 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  30.5 
 
 
492 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  29.31 
 
 
525 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  29.13 
 
 
521 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2097  hypothetical protein  30.98 
 
 
525 aa  204  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  29.13 
 
 
525 aa  204  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  29.13 
 
 
525 aa  204  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  29.13 
 
 
525 aa  204  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  29.13 
 
 
521 aa  204  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  31.56 
 
 
478 aa  203  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  29.41 
 
 
480 aa  203  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  29.08 
 
 
495 aa  203  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  32.33 
 
 
488 aa  203  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  31.56 
 
 
478 aa  203  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  31.56 
 
 
478 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  30.57 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  31.56 
 
 
478 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  31.56 
 
 
478 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  29.3 
 
 
520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  29.51 
 
 
521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  31.36 
 
 
478 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  31.16 
 
 
478 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  31.56 
 
 
478 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  28.94 
 
 
521 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  31.36 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  30.78 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  30.78 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  30.78 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  29.77 
 
 
483 aa  196  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  28.91 
 
 
492 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  29.25 
 
 
491 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  31.33 
 
 
503 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  31.66 
 
 
525 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  28.65 
 
 
494 aa  192  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  29.55 
 
 
492 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  29.48 
 
 
491 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  28.98 
 
 
486 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  29.55 
 
 
502 aa  188  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  30.38 
 
 
500 aa  188  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  30.43 
 
 
507 aa  187  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  30.12 
 
 
517 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  28.03 
 
 
480 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  28.03 
 
 
480 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  28.17 
 
 
480 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  29.86 
 
 
483 aa  186  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  28.9 
 
 
487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  28.21 
 
 
487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1864  hypothetical protein  28.84 
 
 
544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  30.75 
 
 
529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  32.45 
 
 
488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  28.02 
 
 
529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  30.5 
 
 
494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  28.03 
 
 
480 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  28.3 
 
 
487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  28.03 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  30.1 
 
 
496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  28.17 
 
 
491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  29.12 
 
 
491 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>