225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1849 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0538  hypothetical protein  59.27 
 
 		 564 aa  721    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13031  hypothetical protein  55.75 
 
 		 567 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1455  hypothetical protein  55.46 
 
 		 566 aa  692    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1516  hypothetical protein  56.77 
 
 		 557 aa  666    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0533389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1224  hypothetical protein  55.75 
 
 		 567 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06141  hypothetical protein  56.41 
 
 		 567 aa  695    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01523  hypothetical protein  59.76 
 
 		 567 aa  725    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2445  hypothetical protein  64.74 
 
 		 567 aa  791    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1849  hypothetical protein  100 
 
 		 586 aa  1225    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12961  hypothetical protein  55.05 
 
 		 567 aa  663    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.646807  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12881  hypothetical protein  55.92 
 
 		 567 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.446292  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12841  hypothetical protein  59.62 
 
 		 564 aa  727    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.411395  normal  0.708287 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05771  hypothetical protein  60.98 
 
 		 567 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.90155 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29423  predicted protein  39.68 
 
 		 669 aa  400  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929272  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42069  predicted protein  38.26 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22659  predicted protein  35.9 
 
 		 638 aa  351  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6099  protein of unknown function UPF0061  33.16 
 
 		 548 aa  246  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2639  hypothetical protein  33.04 
 
 		 524 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2793  hypothetical protein  31.83 
 
 		 522 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00396  hypothetical protein  34.11 
 
 		 518 aa  231  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2062  hypothetical protein  31.55 
 
 		 533 aa  226  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.413153  normal  0.465678 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1788  hypothetical protein  33.09 
 
 		 518 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  34.05 
 
 		 495 aa  223  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2147  hypothetical protein  30.81 
 
 		 515 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  33.46 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1627  hypothetical protein  32.04 
 
 		 521 aa  216  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248376  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1510  hypothetical protein  30.45 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  32.33 
 
 		 529 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  32.76 
 
 		 498 aa  213  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  31.74 
 
 		 505 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  31.89 
 
 		 529 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  31.85 
 
 		 518 aa  207  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2097  hypothetical protein  31.66 
 
 		 525 aa  205  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  33.07 
 
 		 492 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  32.55 
 
 		 504 aa  203  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  33.46 
 
 		 494 aa  203  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  32.16 
 
 		 487 aa  203  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  31.52 
 
 		 518 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2185  hypothetical protein  31.72 
 
 		 525 aa  200  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  32.05 
 
 		 499 aa  200  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  30.78 
 
 		 522 aa  200  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  31.01 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  31.01 
 
 		 521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  31.09 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  31.01 
 
 		 525 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  31.01 
 
 		 525 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  31.01 
 
 		 525 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  31.01 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  30.98 
 
 		 486 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  33.08 
 
 		 488 aa  194  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  32.5 
 
 		 494 aa  194  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  31.52 
 
 		 497 aa  193  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  32.2 
 
 		 525 aa  193  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1800  hypothetical protein  31.64 
 
 		 476 aa  193  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  29.71 
 
 		 520 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  30.4 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  30.4 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  30.97 
 
 		 522 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  30.22 
 
 		 522 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  31.89 
 
 		 510 aa  190  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  30.45 
 
 		 486 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  30.33 
 
 		 540 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  30.98 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  29.87 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  29.87 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  29.87 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1589  hypothetical protein  30.96 
 
 		 521 aa  189  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510421  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  31.41 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  30.26 
 
 		 540 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  30.8 
 
 		 500 aa  187  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  31.12 
 
 		 496 aa  187  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  30.22 
 
 		 480 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  31.05 
 
 		 487 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  31.97 
 
 		 491 aa  187  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  31.5 
 
 		 487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  31.57 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  30.33 
 
 		 486 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  30.04 
 
 		 480 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  30.04 
 
 		 480 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  30.04 
 
 		 480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  30.04 
 
 		 480 aa  183  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  31.94 
 
 		 496 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  29.62 
 
 		 488 aa  182  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  29.64 
 
 		 489 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  30.48 
 
 		 483 aa  180  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  30.1 
 
 		 478 aa  180  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  29.96 
 
 		 492 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  29.9 
 
 		 478 aa  179  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  31.25 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  29.71 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  29.57 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  30.17 
 
 		 478 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  29.79 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  29.03 
 
 		 483 aa  179  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0444  hypothetical protein  31.4 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734273  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  31.07 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1864  hypothetical protein  30.31 
 
 		 544 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  30.57 
 
 		 485 aa  179  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  29.84 
 
 		 478 aa  179  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  31.27 
 
 		 507 aa  179  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>