225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00396 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00396  hypothetical protein  100 
 
 
518 aa  1059    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1627  hypothetical protein  70.23 
 
 
521 aa  704    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248376  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2097  hypothetical protein  70.13 
 
 
525 aa  733    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2639  hypothetical protein  63.36 
 
 
524 aa  644    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2185  hypothetical protein  69.94 
 
 
525 aa  731    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6099  protein of unknown function UPF0061  58.38 
 
 
548 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120192  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1788  hypothetical protein  58.8 
 
 
518 aa  579  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1510  hypothetical protein  54.88 
 
 
565 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2062  hypothetical protein  51.11 
 
 
533 aa  526  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.413153  normal  0.465678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2793  hypothetical protein  49.33 
 
 
522 aa  522  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2147  hypothetical protein  49.72 
 
 
515 aa  488  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354492  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  45.33 
 
 
487 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  45.33 
 
 
483 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  45.86 
 
 
478 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  45.66 
 
 
478 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  45.45 
 
 
478 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  45.66 
 
 
478 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  45.66 
 
 
478 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  45.66 
 
 
478 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  45.86 
 
 
478 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  45.64 
 
 
478 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  46.34 
 
 
492 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  45.25 
 
 
480 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  45.25 
 
 
480 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  45.45 
 
 
480 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  45.05 
 
 
478 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  45.4 
 
 
540 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  45.05 
 
 
480 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  44.83 
 
 
483 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  45.25 
 
 
480 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  45.51 
 
 
488 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  45.8 
 
 
522 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  43.88 
 
 
480 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  45 
 
 
522 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  45.8 
 
 
522 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  45.4 
 
 
522 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  43.41 
 
 
483 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  45 
 
 
522 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  44.64 
 
 
483 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  45 
 
 
522 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  45 
 
 
520 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  42.64 
 
 
483 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  44.75 
 
 
525 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  41.72 
 
 
484 aa  362  6e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  41.72 
 
 
484 aa  362  6e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  41.72 
 
 
484 aa  362  6e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  44.75 
 
 
525 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  44.75 
 
 
525 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  44.75 
 
 
525 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  45.22 
 
 
507 aa  362  9e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  44.75 
 
 
521 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  44.27 
 
 
518 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  44.75 
 
 
521 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  44.75 
 
 
521 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  43.66 
 
 
505 aa  359  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  43.46 
 
 
518 aa  359  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  45.9 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  45.27 
 
 
499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1800  hypothetical protein  43.52 
 
 
476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  43.47 
 
 
480 aa  358  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  44.69 
 
 
529 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  44.69 
 
 
529 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  44.72 
 
 
498 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  45.4 
 
 
495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  44.17 
 
 
494 aa  353  5.9999999999999994e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  44.51 
 
 
510 aa  352  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1864  hypothetical protein  44.75 
 
 
544 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  45 
 
 
495 aa  350  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  45 
 
 
521 aa  349  9e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  45.26 
 
 
525 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  44.22 
 
 
504 aa  348  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  47.54 
 
 
503 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  40.29 
 
 
488 aa  341  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  42.83 
 
 
497 aa  341  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  39.19 
 
 
486 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  42.01 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  43.92 
 
 
496 aa  339  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0330  hypothetical protein  41.6 
 
 
484 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  40.27 
 
 
494 aa  335  9e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  45.44 
 
 
500 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1589  hypothetical protein  42.58 
 
 
521 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510421  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  39 
 
 
486 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  41.85 
 
 
517 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  38.61 
 
 
486 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  40.66 
 
 
487 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  42.47 
 
 
502 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  41.55 
 
 
484 aa  330  4e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  41.13 
 
 
489 aa  330  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  39.27 
 
 
493 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4038  hypothetical protein  41.8 
 
 
484 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  42.66 
 
 
491 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  38.61 
 
 
540 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  41.63 
 
 
500 aa  329  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3961  protein of unknown function UPF0061  41.8 
 
 
484 aa  329  9e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0299  hypothetical protein  40.04 
 
 
484 aa  329  9e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.281657  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  42.62 
 
 
498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4063  hypothetical protein  41.6 
 
 
484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145391  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  43.04 
 
 
497 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3645  hypothetical protein  40.04 
 
 
484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.348897  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4156  hypothetical protein  41.6 
 
 
484 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246643  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>