225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1510 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1510  hypothetical protein  100 
 
 
565 aa  1170    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2639  hypothetical protein  57.51 
 
 
524 aa  600  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6099  protein of unknown function UPF0061  55.91 
 
 
548 aa  599  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120192  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1788  hypothetical protein  55.51 
 
 
518 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00396  hypothetical protein  55.7 
 
 
518 aa  569  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2185  hypothetical protein  52.71 
 
 
525 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2062  hypothetical protein  51.09 
 
 
533 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.413153  normal  0.465678 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1627  hypothetical protein  52.57 
 
 
521 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248376  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2097  hypothetical protein  53.49 
 
 
525 aa  538  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2793  hypothetical protein  47.62 
 
 
522 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2147  hypothetical protein  47.62 
 
 
515 aa  499  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354492  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  44.61 
 
 
522 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  44.24 
 
 
522 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  43.55 
 
 
480 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  43.93 
 
 
480 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  44.24 
 
 
522 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  44.34 
 
 
522 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  44.16 
 
 
522 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  44.83 
 
 
499 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  42.46 
 
 
488 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  44.07 
 
 
540 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  43.16 
 
 
480 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  42.97 
 
 
480 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  42.97 
 
 
480 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  43.97 
 
 
522 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  41.91 
 
 
483 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  44.1 
 
 
525 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  43.73 
 
 
521 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  43.73 
 
 
525 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  43.73 
 
 
525 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  43.73 
 
 
525 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  44.32 
 
 
507 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  43.73 
 
 
521 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  43.55 
 
 
521 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  40.99 
 
 
487 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  41.36 
 
 
483 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  40.99 
 
 
483 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  40.81 
 
 
483 aa  365  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  42.32 
 
 
505 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  41.81 
 
 
478 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  45.7 
 
 
503 aa  361  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  41.81 
 
 
478 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  42.36 
 
 
492 aa  361  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  42.29 
 
 
518 aa  359  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  41.59 
 
 
478 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  41.43 
 
 
478 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  42 
 
 
518 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  41.76 
 
 
525 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  41.24 
 
 
480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  41.39 
 
 
478 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  39.59 
 
 
483 aa  356  5e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  41.59 
 
 
478 aa  356  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  41.39 
 
 
478 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  41.39 
 
 
478 aa  356  6.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  42.29 
 
 
520 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  41.01 
 
 
478 aa  353  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  39.92 
 
 
484 aa  353  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  39.92 
 
 
484 aa  353  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  39.92 
 
 
484 aa  353  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  43.01 
 
 
521 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  38.97 
 
 
488 aa  352  8.999999999999999e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  41.76 
 
 
494 aa  352  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  40.85 
 
 
480 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  39.74 
 
 
489 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  41.92 
 
 
504 aa  350  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1864  hypothetical protein  40.54 
 
 
544 aa  350  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  41.73 
 
 
498 aa  349  7e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  39.16 
 
 
489 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  41.59 
 
 
496 aa  348  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  39.15 
 
 
486 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  40.33 
 
 
529 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  39.96 
 
 
529 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  38.24 
 
 
486 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  39.77 
 
 
508 aa  339  7e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  37.92 
 
 
540 aa  339  8e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  40.87 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  40.56 
 
 
497 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  41.54 
 
 
495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  41.18 
 
 
487 aa  337  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  42.66 
 
 
497 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  40.08 
 
 
510 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  38.42 
 
 
486 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  41.34 
 
 
495 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  40.57 
 
 
498 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  42.69 
 
 
497 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  37.98 
 
 
485 aa  333  7.000000000000001e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1800  hypothetical protein  40.54 
 
 
476 aa  333  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  38.97 
 
 
487 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  41.14 
 
 
500 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  39.33 
 
 
481 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0330  hypothetical protein  37.19 
 
 
484 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  38.95 
 
 
481 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  38.24 
 
 
487 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  39.7 
 
 
496 aa  324  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  37.87 
 
 
494 aa  324  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  38.72 
 
 
491 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  40.24 
 
 
502 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  38.05 
 
 
487 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  39.36 
 
 
492 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  38.15 
 
 
484 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>