225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1627 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2185  hypothetical protein  62.98 
 
 		 525 aa  662    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1627  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1058    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248376  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00396  hypothetical protein  70.23 
 
 		 518 aa  733    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2097  hypothetical protein  63.18 
 
 		 525 aa  670    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2639  hypothetical protein  61.54 
 
 		 524 aa  629  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1788  hypothetical protein  58.33 
 
 		 518 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6099  protein of unknown function UPF0061  57.06 
 
 		 548 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1510  hypothetical protein  54.04 
 
 		 565 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2062  hypothetical protein  51.7 
 
 		 533 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.413153  normal  0.465678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2793  hypothetical protein  47.21 
 
 		 522 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2147  hypothetical protein  48.85 
 
 		 515 aa  486  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  45.84 
 
 		 492 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  43.42 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  46.69 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  44.81 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  42.86 
 
 		 480 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  42.86 
 
 		 480 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  42.83 
 
 		 518 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  43.47 
 
 		 522 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  42.86 
 
 		 480 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  42.24 
 
 		 518 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  42.86 
 
 		 480 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  42.66 
 
 		 480 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  43.66 
 
 		 478 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  43.08 
 
 		 522 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  43.08 
 
 		 522 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  43.66 
 
 		 478 aa  360  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  43.66 
 
 		 478 aa  359  6e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  45.12 
 
 		 529 aa  359  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  43.46 
 
 		 478 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  44.92 
 
 		 529 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  43.27 
 
 		 522 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  42.3 
 
 		 540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  43.46 
 
 		 478 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  43.95 
 
 		 522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  41.01 
 
 		 487 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  43.27 
 
 		 522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  41.01 
 
 		 483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  43.46 
 
 		 478 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  43.46 
 
 		 478 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  43.16 
 
 		 525 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  43.16 
 
 		 525 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  43.16 
 
 		 521 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  43.16 
 
 		 525 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  43.06 
 
 		 478 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  41.65 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  43.16 
 
 		 525 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  43.16 
 
 		 521 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  42.34 
 
 		 520 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  42.36 
 
 		 483 aa  350  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  42.89 
 
 		 478 aa  349  9e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  40.76 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  41.65 
 
 		 486 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  42.88 
 
 		 525 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1800  hypothetical protein  43.44 
 
 		 476 aa  348  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  41.65 
 
 		 540 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  41.45 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  42.97 
 
 		 521 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  41.78 
 
 		 483 aa  346  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4038  hypothetical protein  42.2 
 
 		 484 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  44.69 
 
 		 507 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1864  hypothetical protein  42.01 
 
 		 544 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  42.22 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3961  protein of unknown function UPF0061  42 
 
 		 484 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  43.61 
 
 		 498 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4063  hypothetical protein  41.8 
 
 		 484 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145391  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4156  hypothetical protein  41.8 
 
 		 484 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  42.01 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  43.84 
 
 		 504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  43.17 
 
 		 487 aa  340  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  41.09 
 
 		 483 aa  339  8e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  42.58 
 
 		 521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0330  hypothetical protein  40.76 
 
 		 484 aa  336  7e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1589  hypothetical protein  43.44 
 
 		 521 aa  335  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510421  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  42.19 
 
 		 497 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  43.48 
 
 		 495 aa  335  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  43.26 
 
 		 494 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  39.76 
 
 		 489 aa  335  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  43.48 
 
 		 495 aa  334  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0308  hypothetical protein  40.56 
 
 		 483 aa  333  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0254223  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0299  hypothetical protein  39.96 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.281657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3645  hypothetical protein  39.96 
 
 		 484 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.348897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  39 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  39 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  39 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  40.78 
 
 		 496 aa  329  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  38.91 
 
 		 488 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0444  hypothetical protein  42.71 
 
 		 487 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734273  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  41.97 
 
 		 494 aa  324  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3659  hypothetical protein  39.84 
 
 		 484 aa  323  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3841  hypothetical protein  39.56 
 
 		 484 aa  323  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.261021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  38.77 
 
 		 489 aa  322  7e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  40.24 
 
 		 484 aa  322  8e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  41.63 
 
 		 496 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  42.62 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  42.54 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  41.16 
 
 		 487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  43.47 
 
 		 500 aa  319  6e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  41.25 
 
 		 486 aa  319  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  41.09 
 
 		 517 aa  319  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>