225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2445 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0538  hypothetical protein  62.25 
 
 		 564 aa  747    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1455  hypothetical protein  58.74 
 
 		 566 aa  714    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13031  hypothetical protein  58.77 
 
 		 567 aa  709    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1516  hypothetical protein  58.63 
 
 		 557 aa  672    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0533389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1224  hypothetical protein  58.77 
 
 		 567 aa  698    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01523  hypothetical protein  63.36 
 
 		 567 aa  766    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2445  hypothetical protein  100 
 
 		 567 aa  1186    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06141  hypothetical protein  59.96 
 
 		 567 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1849  hypothetical protein  64.74 
 
 		 586 aa  791    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12961  hypothetical protein  58.59 
 
 		 567 aa  697    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.646807  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12881  hypothetical protein  58.2 
 
 		 567 aa  727    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.446292  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12841  hypothetical protein  62.61 
 
 		 564 aa  757    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.411395  normal  0.708287 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05771  hypothetical protein  63.6 
 
 		 567 aa  779    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.90155 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29423  predicted protein  39.38 
 
 		 669 aa  380  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929272  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42069  predicted protein  38.24 
 
 		 594 aa  380  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22659  predicted protein  36.19 
 
 		 638 aa  352  8e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00396  hypothetical protein  34.93 
 
 		 518 aa  253  9.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2639  hypothetical protein  34.1 
 
 		 524 aa  249  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2793  hypothetical protein  33.45 
 
 		 522 aa  246  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6099  protein of unknown function UPF0061  33.88 
 
 		 548 aa  244  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1627  hypothetical protein  33.63 
 
 		 521 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248376  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2062  hypothetical protein  32.86 
 
 		 533 aa  229  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.413153  normal  0.465678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  32.96 
 
 		 505 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2147  hypothetical protein  31.2 
 
 		 515 aa  222  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1510  hypothetical protein  31.72 
 
 		 565 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2097  hypothetical protein  31.72 
 
 		 525 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1788  hypothetical protein  30.71 
 
 		 518 aa  217  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  31.55 
 
 		 518 aa  216  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2185  hypothetical protein  32.25 
 
 		 525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  34.02 
 
 		 521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  34.02 
 
 		 521 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  34.02 
 
 		 525 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1800  hypothetical protein  33.01 
 
 		 476 aa  214  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  34.02 
 
 		 525 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  34.02 
 
 		 525 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  34.02 
 
 		 525 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  34.02 
 
 		 521 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  32.52 
 
 		 522 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  34.16 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  32.53 
 
 		 497 aa  210  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  31.77 
 
 		 522 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  30.63 
 
 		 499 aa  209  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  31.04 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  31.58 
 
 		 522 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  31.58 
 
 		 522 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  32.33 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  32.32 
 
 		 495 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  32.32 
 
 		 495 aa  207  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  31.65 
 
 		 496 aa  206  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  32.9 
 
 		 540 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  32.1 
 
 		 522 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  31.94 
 
 		 504 aa  204  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  31.98 
 
 		 494 aa  204  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  33.83 
 
 		 521 aa  204  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  33.66 
 
 		 503 aa  202  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  31.26 
 
 		 529 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  31.71 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  32.1 
 
 		 522 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  33.46 
 
 		 487 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  33.27 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  31.04 
 
 		 520 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  30.82 
 
 		 492 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  30.8 
 
 		 529 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  30.84 
 
 		 487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  32.14 
 
 		 494 aa  196  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  32.04 
 
 		 525 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  30.36 
 
 		 483 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  33.7 
 
 		 507 aa  194  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  32.37 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  33.03 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  33.03 
 
 		 483 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  30.9 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  30.9 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  30.9 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  30.77 
 
 		 486 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  31.27 
 
 		 497 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  31.53 
 
 		 486 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  30.14 
 
 		 491 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  30.74 
 
 		 491 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  31.19 
 
 		 492 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  32.47 
 
 		 491 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  30.4 
 
 		 486 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  31.27 
 
 		 497 aa  191  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  30.33 
 
 		 494 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  30.9 
 
 		 487 aa  190  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  31.3 
 
 		 500 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  30.91 
 
 		 510 aa  190  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  30.55 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  29.72 
 
 		 498 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1589  hypothetical protein  30.86 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510421  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  31.68 
 
 		 496 aa  187  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  29.74 
 
 		 540 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  29.53 
 
 		 471 aa  186  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  31.81 
 
 		 500 aa  186  8e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  30.08 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  29.28 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  30.08 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  30.56 
 
 		 488 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0444  hypothetical protein  31.08 
 
 		 487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734273  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  30.08 
 
 		 478 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>