More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1016 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1016  glutathione peroxidase  100 
 
 
159 aa  328  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0391982  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10951  glutathione peroxidase  94.34 
 
 
159 aa  314  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.960114  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10951  glutathione peroxidase  94.34 
 
 
159 aa  312  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10911  glutathione peroxidase  82.39 
 
 
159 aa  278  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.604809  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11881  glutathione peroxidase  62.89 
 
 
159 aa  221  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.431432  normal  0.0622646 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0091  glutathione peroxidase  63.69 
 
 
174 aa  213  8e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0137  glutathione peroxidase  60.51 
 
 
169 aa  203  9e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01621  glutathione peroxidase  56.6 
 
 
159 aa  196  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1209  glutathione peroxidase  56.96 
 
 
158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20841  glutathione peroxidase  55.7 
 
 
158 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  55.06 
 
 
167 aa  187  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  47.77 
 
 
179 aa  157  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  50.33 
 
 
162 aa  156  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  46.63 
 
 
204 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  50.34 
 
 
162 aa  150  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  43.75 
 
 
163 aa  147  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  45.75 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  47.65 
 
 
161 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  45.03 
 
 
162 aa  144  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  47.26 
 
 
198 aa  144  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  42.22 
 
 
182 aa  144  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  45.16 
 
 
160 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  44.52 
 
 
160 aa  143  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  48.3 
 
 
160 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  46.26 
 
 
160 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  43.21 
 
 
166 aa  141  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  41.44 
 
 
183 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  45.64 
 
 
160 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  42.17 
 
 
182 aa  140  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  46.26 
 
 
160 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  43.87 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  44.03 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  42.24 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  44.13 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  43.23 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  41.34 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  44 
 
 
165 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  46.98 
 
 
160 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  43.87 
 
 
162 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  43.12 
 
 
167 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  47.41 
 
 
159 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  49.64 
 
 
160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  49.64 
 
 
160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  49.64 
 
 
160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  39.01 
 
 
183 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  39.23 
 
 
183 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  39.23 
 
 
183 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  43.62 
 
 
164 aa  137  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  49.64 
 
 
160 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  43.58 
 
 
182 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  40.33 
 
 
183 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  49.31 
 
 
160 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  49.31 
 
 
160 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  44.03 
 
 
158 aa  137  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  48.91 
 
 
161 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  37.57 
 
 
183 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  42.07 
 
 
173 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  42.51 
 
 
182 aa  136  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  48.18 
 
 
160 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  43.12 
 
 
161 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  48.91 
 
 
160 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  44.44 
 
 
160 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  46.81 
 
 
185 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  40.33 
 
 
183 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  39.78 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  39.78 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  39.78 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  38.67 
 
 
183 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  38.67 
 
 
183 aa  134  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  43.71 
 
 
161 aa  134  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  39.78 
 
 
183 aa  134  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  39.78 
 
 
183 aa  134  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  44.52 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  37.02 
 
 
183 aa  134  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  46 
 
 
160 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  40.76 
 
 
210 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  43.51 
 
 
158 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  43.05 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  44.37 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  44.37 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  44.37 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  46 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  44.81 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  39.43 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  42.86 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  40.85 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  45.75 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  42.24 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  45.27 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  45.27 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  46 
 
 
164 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  42.86 
 
 
173 aa  131  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  42.86 
 
 
165 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  41.77 
 
 
162 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  40.14 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  41.07 
 
 
183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  42.57 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  39.23 
 
 
183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  42.86 
 
 
165 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  38.12 
 
 
183 aa  131  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>