114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0582 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0582  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06081  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  92.66 
 
 		 327 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  92.05 
 
 		 327 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06471  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  80.95 
 
 		 294 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  51.88 
 
 		 328 aa  328  8e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0655453  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0018  hypothetical protein  51.53 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1016  hypothetical protein  46.58 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  46.58 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18351  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  46.01 
 
 		 333 aa  318  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.279534 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10701  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  48.61 
 
 		 333 aa  309  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.638537 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1087  hypothetical protein  39.56 
 
 		 324 aa  245  8e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000930437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 		 319 aa  235  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5160  NmrA family protein  35.51 
 
 		 318 aa  220  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.99 
 
 		 315 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0116647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0770321  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.73 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  22.03 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.28 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.29 
 
 		 352 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 357 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2297  GDP-D-mannose dehydratase, putative  25.78 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3293  WcbK  25.78 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0531  putative GDP-D-mannose dehydratase  25.78 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1069  putative GDP-D-mannose dehydratase  25.78 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3244  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  25.78 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3279  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  25.78 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.409914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2175  putative GDP-D-mannose dehydratase  25.78 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  33.33 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.84 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.35 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  25.2 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  27.12 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.17 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  21.2 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0684  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  22.61 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556189  normal  0.226818 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.37 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  20.32 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  22.99 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  20.32 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0266  hypothetical protein  27.45 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  25.19 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.62 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2324  VI polysaccharide biosynthesis protein vipB/tviC  25.16 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  27.64 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  25.42 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0768033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  27.41 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.41 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  21.03 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1007  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  24.59 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.09 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.33 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4586  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.45 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  24.43 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.18 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.39 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  27.12 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.23 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  24.43 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.98 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  25.62 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 		 373 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  21.39 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.13 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 		 377 aa  42.7  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.39 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1109  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.87 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0016  hypothetical protein  29.41 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  22.37 
 
 		 337 aa  42.7  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.27 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>