71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1230 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  832    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  41.46 
 
 
373 aa  193  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
442 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
442 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
436 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  31.88 
 
 
306 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  31.49 
 
 
396 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
272 aa  136  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  31.78 
 
 
272 aa  136  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
477 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
646 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  30.77 
 
 
376 aa  113  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  30.59 
 
 
1635 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  31.49 
 
 
351 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  30.11 
 
 
1085 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
995 aa  67.8  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  27.34 
 
 
233 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.49 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  28.16 
 
 
282 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  22.76 
 
 
185 aa  50.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  24.26 
 
 
285 aa  50.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  33.33 
 
 
206 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00750  hypothetical protein  23.03 
 
 
383 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  32.67 
 
 
206 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  26.21 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  26.21 
 
 
273 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 
235 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  30.39 
 
 
447 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  31.11 
 
 
206 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  30.39 
 
 
447 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  28 
 
 
227 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  31.11 
 
 
206 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  33.9 
 
 
231 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0924  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
247 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  33.9 
 
 
230 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.18 
 
 
260 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  27.67 
 
 
306 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  25.95 
 
 
261 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  23.24 
 
 
286 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  20.54 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  23.94 
 
 
304 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 
507 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  22.42 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  23.67 
 
 
206 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  21.05 
 
 
258 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5098  methionine biosynthesis protein MetW  28.41 
 
 
212 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5148  methionine biosynthesis protein MetW  28.41 
 
 
206 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.740945  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  26.89 
 
 
488 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05070  putative methionine biosynthesis protein  30 
 
 
206 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  21.94 
 
 
332 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  22.22 
 
 
310 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0488  methionine biosynthesis protein MetW  30 
 
 
206 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4971  methionine biosynthesis protein MetW  28.41 
 
 
206 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
262 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  27.03 
 
 
306 aa  44.3  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  22.14 
 
 
358 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  36.76 
 
 
309 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  35.42 
 
 
231 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13866  hypothetical protein  24.39 
 
 
191 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0574  methionine biosynthesis protein MetW  24.03 
 
 
215 aa  43.9  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 
248 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
248 aa  43.5  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1638  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 
235 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
248 aa  43.5  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
209 aa  43.5  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03030  methionine biosynthesis protein MetW  28.41 
 
 
199 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.767976  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0346  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.6 
 
 
235 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.423606  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0369  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.6 
 
 
235 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0467778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  29.41 
 
 
290 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  25 
 
 
240 aa  42.7  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  29.41 
 
 
290 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>