69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43296 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_43296  predicted protein  100 
 
 		 370 aa  755    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05934  alpha-tubulin suppressor protein Aats1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10700)  33.75 
 
 		 500 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.18 
 
 		 818 aa  73.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  26.04 
 
 		 900 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.89 
 
 		 821 aa  67  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.43 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  26.02 
 
 		 717 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  23.68 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  23.71 
 
 		 558 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  28.33 
 
 		 553 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  29.73 
 
 		 778 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.48 
 
 		 556 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  29.05 
 
 		 579 aa  59.7  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 2082 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  25.36 
 
 		 577 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6750  predicted protein  33.96 
 
 		 212 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0046022  normal  0.726599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.27 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  29.25 
 
 		 807 aa  56.6  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  23.91 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  23.61 
 
 		 911 aa  56.6  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  28.48 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  23.48 
 
 		 643 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  29.14 
 
 		 714 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  28.81 
 
 		 743 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  23.65 
 
 		 546 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  26.34 
 
 		 569 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  26.46 
 
 		 477 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  29.71 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  28.93 
 
 		 776 aa  52.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  26.91 
 
 		 547 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  22.74 
 
 		 561 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  38.1 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  29.21 
 
 		 593 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.57 
 
 		 1919 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32200  predicted protein  23.3 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.457175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.92 
 
 		 567 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.57 
 
 		 1679 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  23.72 
 
 		 728 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.19 
 
 		 555 aa  49.7  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  25.25 
 
 		 558 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  27.68 
 
 		 618 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  30.14 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  30.14 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.42 
 
 		 1126 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.07 
 
 		 563 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  28.43 
 
 		 792 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.96 
 
 		 570 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  25.33 
 
 		 643 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  28.57 
 
 		 566 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47675  predicted protein  31.68 
 
 		 491 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  26.37 
 
 		 551 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  29.17 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  28.79 
 
 		 784 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  23.94 
 
 		 1848 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02730  hypothetical protein  25.11 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.42672  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.97 
 
 		 555 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.33 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  24.82 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  25.5 
 
 		 554 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  32.95 
 
 		 1312 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  25.49 
 
 		 558 aa  43.9  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  25.9 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  21.16 
 
 		 706 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  28.12 
 
 		 727 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  26.23 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  25.93 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.78 
 
 		 692 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  23.83 
 
 		 737 aa  43.1  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>