61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_52678 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_03067  DNA polymerase epsilon catalytic subunit A (DNA polymerase II subunit A)(EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93845]  37.61 
 
 		 2207 aa  1377    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.958905 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_52678  DNA polymerase epsilon catalytic subunit that participates with PCNA in late in S phase DNA replication  100 
 
 		 2155 aa  4480    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562682  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_150  predicted protein  38.35 
 
 		 2198 aa  1385    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.710895  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01430  DNA polymerase epsilon, catalytic subunit a, putative  38.01 
 
 		 2250 aa  1414    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352674  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66970  DNA-directed DNA polymerase epsilon, catalytic subunit A  36.32 
 
 		 2222 aa  1357    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363259 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  23.91 
 
 		 780 aa  76.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  23.16 
 
 		 781 aa  74.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  22.89 
 
 		 780 aa  72  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0005  DNA-directed DNA polymerase B  25.5 
 
 		 792 aa  68.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.775002  normal  0.276245 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  23.89 
 
 		 810 aa  67.4  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  23.87 
 
 		 910 aa  67.4  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0296  DNA polymerase B region  25.54 
 
 		 743 aa  61.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413746  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  29.07 
 
 		 796 aa  60.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  27.76 
 
 		 932 aa  59.7  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  25.27 
 
 		 810 aa  58.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  24.56 
 
 		 810 aa  58.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  23.86 
 
 		 787 aa  57.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  25.24 
 
 		 816 aa  57.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  22.27 
 
 		 786 aa  57.8  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  25.59 
 
 		 788 aa  57.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  28.24 
 
 		 941 aa  56.6  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  25.62 
 
 		 808 aa  56.2  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  24.84 
 
 		 854 aa  55.8  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0006  DNA polymerase B region  26.82 
 
 		 800 aa  55.8  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0104933 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  20.47 
 
 		 794 aa  55.5  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  23.57 
 
 		 854 aa  55.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  24.47 
 
 		 811 aa  54.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  25 
 
 		 789 aa  53.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  23.08 
 
 		 810 aa  53.9  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0006  cyclic nucleotide-binding protein  26.36 
 
 		 793 aa  53.5  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  22.61 
 
 		 794 aa  53.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  24.19 
 
 		 787 aa  53.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  26.22 
 
 		 789 aa  52.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  26.42 
 
 		 789 aa  52  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  26.42 
 
 		 789 aa  52  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  23.05 
 
 		 797 aa  52.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  26.42 
 
 		 789 aa  52.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  25.4 
 
 		 786 aa  51.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  25.34 
 
 		 784 aa  51.6  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  22.66 
 
 		 1485 aa  51.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  24.57 
 
 		 809 aa  51.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  23.65 
 
 		 853 aa  50.1  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  26.21 
 
 		 787 aa  49.7  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3187  DNA polymerase B, exonuclease  25.42 
 
 		 744 aa  49.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163636 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  28.37 
 
 		 783 aa  49.3  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2007  DNA-directed DNA polymerase B  29.82 
 
 		 788 aa  49.3  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  25 
 
 		 786 aa  49.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  24.28 
 
 		 786 aa  49.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  21.71 
 
 		 982 aa  48.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  25 
 
 		 786 aa  48.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1412  DNA polymerase B region  25 
 
 		 785 aa  48.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  24.14 
 
 		 835 aa  48.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  24.66 
 
 		 852 aa  48.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  25 
 
 		 723 aa  48.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  23.32 
 
 		 853 aa  48.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  26.19 
 
 		 786 aa  47.8  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  26.43 
 
 		 788 aa  47  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  27.48 
 
 		 795 aa  46.6  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  23.27 
 
 		 783 aa  46.2  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  22 
 
 		 818 aa  45.8  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3245  DNA polymerase II, putative  33.33 
 
 		 745 aa  45.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>