138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49488 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49488  predicted protein  100 
 
 
364 aa  754    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27908  predicted protein  33.91 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.789024  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29867  predicted protein  31.25 
 
 
354 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.953466  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  32.22 
 
 
327 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  31.44 
 
 
306 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  27.82 
 
 
310 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  27.82 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  26.4 
 
 
310 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  31.3 
 
 
318 aa  89.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  27.41 
 
 
303 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  30.08 
 
 
307 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  29.67 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  29.67 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  26.03 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  27.57 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  25.81 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  29.27 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  25.9 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  28.91 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  27.02 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  26.96 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  26.32 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  28.7 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  29.02 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  28.17 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  25.29 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  26.61 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  27.95 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  27.71 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  27.19 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  29.31 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  25.66 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  22.86 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  28.99 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  23 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  24.71 
 
 
305 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04190  conserved hypothetical protein  29.08 
 
 
538 aa  70.9  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  27.16 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  26.42 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  25.16 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  25.66 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  27.6 
 
 
308 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  26.86 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  26.86 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  23.32 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  26.45 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  25.42 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  28.94 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06909  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997625  normal  0.453793 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  24.9 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  23.75 
 
 
277 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0042  hypothetical protein  25.6 
 
 
286 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87902  predicted protein  23.42 
 
 
425 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0889965  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  26.47 
 
 
312 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  26.05 
 
 
305 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  24.62 
 
 
303 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  26.2 
 
 
305 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46365  predicted protein  25.41 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207077  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0043  hypothetical protein  25.79 
 
 
286 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30233  predicted protein  23.88 
 
 
949 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.204381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  23.75 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26635  predicted protein  28.15 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  25.79 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  27.7 
 
 
302 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2382  hypothetical protein  21.63 
 
 
321 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000769788  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  24.14 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  28.51 
 
 
307 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  24.55 
 
 
299 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1856  protein of unknown function UPF0187  26.92 
 
 
308 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  26.16 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  29.08 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  28.7 
 
 
306 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0159481 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02251  UPF0187 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06660)  32.52 
 
 
499 aa  59.7  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.493837  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46366  predicted protein  24.12 
 
 
519 aa  59.7  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0951479  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  26.19 
 
 
306 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  25.62 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  25.29 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  26.19 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  24.43 
 
 
308 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  26.19 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  24.17 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  26.02 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  28.18 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  24.66 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  25.61 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  28.18 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  28.18 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  24.17 
 
 
314 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  28.18 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  28.18 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  28.18 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  28.18 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  27.31 
 
 
321 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  26.7 
 
 
306 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37111  predicted protein  28.08 
 
 
433 aa  57  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  23.26 
 
 
303 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  23.53 
 
 
307 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  25.31 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  28.38 
 
 
306 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>