43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49312 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49312  predicted protein  100 
 
 		 1592 aa  3292    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83988  predicted protein  22.86 
 
 		 1564 aa  159  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30739  predicted protein  27.89 
 
 		 1393 aa  156  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.471952  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00576  phosphoinositide-3-kinase, regulatory protein Vps15 (Eurofung)  31.47 
 
 		 1599 aa  140  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451454  normal  0.366733 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01680  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 1535 aa  103  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  29.25 
 
 		 1280 aa  62  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  20.57 
 
 		 1831 aa  59.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 505 aa  58.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  19.26 
 
 		 1229 aa  57.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.68 
 
 		 733 aa  54.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2878  serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 		 626 aa  54.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0943  Serine/threonine protein kinase-like protein  27.75 
 
 		 489 aa  53.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.646835  normal  0.789062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  20.09 
 
 		 1363 aa  53.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.05 
 
 		 1161 aa  53.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.74 
 
 		 1161 aa  53.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1253  WD-40 repeat protein  21.34 
 
 		 960 aa  52.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.09 
 
 		 1868 aa  52  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.89 
 
 		 1766 aa  51.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.11 
 
 		 1901 aa  51.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  21.82 
 
 		 1330 aa  51.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.18 
 
 		 898 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05250  protein kinase, putative  30.51 
 
 		 1002 aa  50.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.33 
 
 		 1474 aa  50.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.15 
 
 		 1188 aa  49.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0491  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 1070 aa  49.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.424967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  23.13 
 
 		 1160 aa  48.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01970  cyclin dependent kinase C, putative  24.49 
 
 		 1030 aa  48.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3194  cytochrome c class I  29.51 
 
 		 428 aa  48.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20 
 
 		 1481 aa  48.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  20.25 
 
 		 464 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01335  protein transport protein (LST8), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09560)  33.33 
 
 		 393 aa  47.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.809459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.45 
 
 		 792 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  37.65 
 
 		 346 aa  47.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  21.83 
 
 		 1411 aa  47  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.63 
 
 		 650 aa  47  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01130  conserved hypothetical protein  32.97 
 
 		 338 aa  46.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.85 
 
 		 1856 aa  46.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  20.9 
 
 		 1242 aa  46.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1211 aa  46.2  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  27.7 
 
 		 951 aa  45.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  21.9 
 
 		 1164 aa  45.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.04 
 
 		 681 aa  45.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65437  predicted protein  25.23 
 
 		 702 aa  45.1  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.653403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>