More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47306 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47306  predicted protein  100 
 
 		 193 aa  400  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42566  predicted protein  41.27 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000000723214  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  39.05 
 
 		 106 aa  88.2  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  33.98 
 
 		 570 aa  85.5  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  31.34 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05970  disulfide isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10590)  32.99 
 
 		 731 aa  76.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.371345 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02410  conserved hypothetical protein  30.51 
 
 		 492 aa  75.5  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  30.77 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9171  predicted protein  36.25 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  28.44 
 
 		 555 aa  70.9  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05350  protein disulfide isomerase, putative  31.62 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  37.62 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32213  predicted protein  26.8 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0281124 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00248  PDI related protein A (Eurofung)  32.14 
 
 		 455 aa  68.2  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  29.52 
 
 		 513 aa  68.2  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_7719  predicted protein  37.97 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0652282  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2808  predicted protein  28.15 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11781  predicted protein  30.39 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5385  predicted protein  43.55 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.117735 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9208  predicted protein  30.77 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00482612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  32.58 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  32.58 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  30.88 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  29.7 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  30.11 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  34.44 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  30.39 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  29.35 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  28.71 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  29.63 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  35.64 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14990  predicted protein  28.57 
 
 		 467 aa  58.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  29.03 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67636  predicted protein  32.18 
 
 		 769 aa  58.5  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.969008 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42712  predicted protein  25 
 
 		 513 aa  58.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.732004  normal  0.929724 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2484  predicted protein  27.93 
 
 		 443 aa  58.2  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.632802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  28.71 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  30.77 
 
 		 109 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  32.58 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  31.33 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  34.34 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  28.3 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  29.55 
 
 		 113 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  30.61 
 
 		 107 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  30.12 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  31.71 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  34.29 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  30.77 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  34.15 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  32.86 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  32.05 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43106  predicted protein  26.13 
 
 		 520 aa  55.1  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  35.37 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  28.92 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  29.07 
 
 		 406 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  31.65 
 
 		 130 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  30.77 
 
 		 105 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  30.48 
 
 		 109 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  34.29 
 
 		 108 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2277  Thioredoxin domain protein  27.93 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00669131  hitchhiker  0.000000625569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  30.77 
 
 		 108 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  30.61 
 
 		 107 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  30.77 
 
 		 108 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  30.77 
 
 		 108 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  34.29 
 
 		 108 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  34.29 
 
 		 108 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  27.27 
 
 		 111 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  28.97 
 
 		 107 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  27.36 
 
 		 107 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  30.77 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  28.97 
 
 		 108 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  27.96 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  31.58 
 
 		 106 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  27.18 
 
 		 122 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  31.33 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  30.19 
 
 		 107 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  30.19 
 
 		 107 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  29.13 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  27.88 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  30.19 
 
 		 107 aa  52.8  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  28.85 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  25.24 
 
 		 108 aa  53.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  26.67 
 
 		 110 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  27.62 
 
 		 110 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  27.62 
 
 		 110 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  26.92 
 
 		 104 aa  52.4  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  29.52 
 
 		 108 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>