More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19699 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_19699  1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase  100 
 
 
503 aa  1044    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.454144  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42674  predicted protein  32.82 
 
 
450 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.234824  normal  0.0688289 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51422  1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase  35.52 
 
 
420 aa  180  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352071  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00744  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 
472 aa  176  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.812131  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02050  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 
529 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.657789  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02564  aminotransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00630)  27.03 
 
 
451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.771081 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03704  hypothetical protein  26.65 
 
 
381 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  24.01 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  24.01 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  24.16 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04153  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 
344 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25 
 
 
534 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  21.98 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  22.25 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  26.11 
 
 
392 aa  76.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  22.16 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  24.47 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0990  aminotransferase  22.39 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0114573  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  27.67 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  25.22 
 
 
390 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  24.02 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  22.64 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  22.47 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  22.42 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1646  aspartate aminotransferase  28.45 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  21.6 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  26.12 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  26.51 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  22.97 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  26.97 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  25.55 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0895  aminotransferase  21.86 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.515472  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.37 
 
 
505 aa  70.9  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  22.32 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  22.32 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  27.57 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  24.66 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  22.75 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  23.35 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  27.51 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  22.06 
 
 
407 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  23.66 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  24.9 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  23.15 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2619  aminotransferase class I and II  23.88 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0994  aspartate aminotransferase  25.08 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1136  aspartate aminotransferase  25.08 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.358682  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  25.66 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  21.33 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  25.13 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  23.14 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  21.82 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  20.15 
 
 
395 aa  67  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2410  aminotransferase class I and II  21.55 
 
 
370 aa  67  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  22.59 
 
 
393 aa  67  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  26.98 
 
 
391 aa  67  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  23.18 
 
 
411 aa  67  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3182  aminotransferase class I and II  23.24 
 
 
392 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  21.66 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  24.08 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  22.88 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  22.58 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  21.89 
 
 
412 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  23.42 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  21.1 
 
 
379 aa  66.6  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  25.07 
 
 
390 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  20.16 
 
 
383 aa  66.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  25.81 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45065  predicted protein  21.2 
 
 
434 aa  66.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.368753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  21.05 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  22.11 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  22.22 
 
 
414 aa  66.6  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0758  aspartate aminotransferase  23.56 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  21.89 
 
 
391 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  25.63 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  24.01 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  25.37 
 
 
400 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  25.15 
 
 
400 aa  65.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  21.89 
 
 
393 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  25.63 
 
 
394 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  21.46 
 
 
398 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  23.22 
 
 
407 aa  65.1  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  23.64 
 
 
413 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  25.33 
 
 
381 aa  65.1  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  26.12 
 
 
404 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  24.68 
 
 
410 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  24.37 
 
 
400 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1956  aminotransferase  24.05 
 
 
398 aa  64.7  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.476214  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  23.46 
 
 
508 aa  64.3  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0567  aminotransferase class I and II  21.31 
 
 
403 aa  64.7  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  23.47 
 
 
400 aa  64.3  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  24.66 
 
 
391 aa  64.3  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  23.96 
 
 
404 aa  64.3  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  21.46 
 
 
398 aa  63.9  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  22.63 
 
 
394 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3276  aminotransferase class I and II  22.7 
 
 
392 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0253836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  22.52 
 
 
388 aa  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  22.85 
 
 
394 aa  63.9  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  22.99 
 
 
398 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  26.12 
 
 
404 aa  63.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>