More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0316 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0316  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  875    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.317147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0847  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 423 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0415  seryl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 423 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0734  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 423 aa  534  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3818  seryl-tRNA synthetase  63.02 
 
 		 430 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0225862  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3604  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 423 aa  526  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0216  seryl-tRNA synthetase  60.19 
 
 		 424 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5630  seryl-tRNA synthetase  61.56 
 
 		 423 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00319039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03775  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 423 aa  517  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.64354  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1519  hypothetical protein  54.72 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.833428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1968  seryl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 426 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.355575  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2731  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 423 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104172 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 424 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 422 aa  363  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 427 aa  360  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 426 aa  358  9e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0695  seryl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0194542  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 431 aa  352  8e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 424 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 420 aa  351  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 425 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 425 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 427 aa  346  6e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 424 aa  345  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0931  seryl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 431 aa  342  8e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 438 aa  342  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 422 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 413 aa  339  7e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 439 aa  338  8e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 422 aa  338  8e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 424 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 423 aa  338  9e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 432 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 422 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 427 aa  336  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 423 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 421 aa  333  4e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 423 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 468 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 423 aa  331  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_516  seryl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 413 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 427 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 427 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 413 aa  330  3e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 427 aa  330  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0744  seryl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 461 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124446  normal  0.521424 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 422 aa  328  9e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl017  seryl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 422 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 424 aa  326  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 425 aa  325  6e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 433 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3445  seryl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 442 aa  325  9e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 442 aa  325  9e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 423 aa  325  9e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0839  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>