258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3001 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  100 
 
 		 176 aa  353  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  73.56 
 
 		 176 aa  270  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  73.56 
 
 		 176 aa  270  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  63.64 
 
 		 176 aa  237  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  63.07 
 
 		 175 aa  230  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  60.8 
 
 		 174 aa  215  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  55.11 
 
 		 172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  35.57 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  29.87 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  32.45 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  27.43 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  27.43 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  31.65 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  27.01 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  30.83 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  30.83 
 
 		 299 aa  61.6  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  30.83 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  30.83 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  37.04 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  37.04 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  31.45 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  37.04 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  30.83 
 
 		 299 aa  60.8  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  36.11 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  29.37 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  30.65 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  30.08 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  31.37 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.1 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  26.67 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  30.25 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  30.66 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  30.99 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  30.25 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  30.4 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2527  CheW-like protein  33.33 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  32.61 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  30.99 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  29.32 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  31.19 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  28.57 
 
 		 295 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  28.57 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  28.57 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  28.57 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  28.57 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  27.56 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  32.86 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  34.07 
 
 		 528 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  28.83 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.02 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  27.56 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  25 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  27.56 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  28.33 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  31.62 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  33.65 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  26.06 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  27.59 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  27.52 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  27.5 
 
 		 171 aa  51.2  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  27.56 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.56 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  27.56 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  27.56 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  26.77 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  26.72 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  32 
 
 		 568 aa  50.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  35.8 
 
 		 779 aa  50.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  26.77 
 
 		 159 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.2 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  31.15 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  26.79 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  27.2 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  27.2 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  27.2 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  28.83 
 
 		 300 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  33.61 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  27.2 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  27.2 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  27.35 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  25.98 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  26.76 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.17 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  27.35 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  33.33 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  26.13 
 
 		 298 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  31.96 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  26.39 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  26.76 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  27.35 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  27.35 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  27.27 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  28 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  29.79 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  29.91 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  27.52 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  25.2 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0265  putative CheW protein  31.21 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  29.91 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  26.12 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>