More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0731 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4995  ABC transporter, transmembrane region  67.88 
 
 		 605 aa  867    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0356136  normal  0.528337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4843  ABC transporter related  70.91 
 
 		 605 aa  896    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0733  ABC transporter related  69.15 
 
 		 605 aa  884    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0731  ABC transporter related  100 
 
 		 605 aa  1232    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0762  ABC transporter related  68.99 
 
 		 605 aa  879    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.72 
 
 		 572 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.57 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  32.01 
 
 		 610 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  32.95 
 
 		 582 aa  287  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.38 
 
 		 572 aa  287  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  32.95 
 
 		 582 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  32.22 
 
 		 603 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.67 
 
 		 572 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.75 
 
 		 566 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  31.83 
 
 		 572 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.27 
 
 		 566 aa  281  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  32.45 
 
 		 603 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  31.83 
 
 		 572 aa  280  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  31.55 
 
 		 601 aa  280  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.91 
 
 		 567 aa  280  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.33 
 
 		 613 aa  279  8e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  32.17 
 
 		 575 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  31.75 
 
 		 567 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  31.09 
 
 		 636 aa  279  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  37.88 
 
 		 728 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  32.8 
 
 		 601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.9 
 
 		 597 aa  274  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  29.75 
 
 		 607 aa  274  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  30.44 
 
 		 607 aa  273  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  31.86 
 
 		 607 aa  273  8.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  30.46 
 
 		 572 aa  273  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  31.65 
 
 		 556 aa  272  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.58 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.35 
 
 		 588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.38 
 
 		 582 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  31 
 
 		 582 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.98 
 
 		 571 aa  270  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  31.34 
 
 		 566 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.1 
 
 		 571 aa  270  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.73 
 
 		 572 aa  270  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.46 
 
 		 588 aa  270  8e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  29.84 
 
 		 571 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.84 
 
 		 571 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.84 
 
 		 571 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.84 
 
 		 571 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.84 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.84 
 
 		 571 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  31.59 
 
 		 606 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.89 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  33.6 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  30.18 
 
 		 591 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  31.55 
 
 		 578 aa  268  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.18 
 
 		 582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.95 
 
 		 579 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  37.17 
 
 		 728 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.2 
 
 		 582 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.84 
 
 		 571 aa  267  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.2 
 
 		 582 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.2 
 
 		 582 aa  267  4e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  36.25 
 
 		 725 aa  267  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.28 
 
 		 600 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  33.27 
 
 		 597 aa  266  8e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  34.09 
 
 		 617 aa  266  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  32.99 
 
 		 575 aa  266  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  29.51 
 
 		 584 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  30.91 
 
 		 607 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  30.05 
 
 		 579 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  32.93 
 
 		 596 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  33.07 
 
 		 595 aa  265  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  29.45 
 
 		 576 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  32.88 
 
 		 584 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.14 
 
 		 628 aa  265  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  32.58 
 
 		 582 aa  265  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.58 
 
 		 582 aa  265  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  32.58 
 
 		 582 aa  265  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  39.39 
 
 		 814 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.58 
 
 		 582 aa  265  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.58 
 
 		 582 aa  265  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.58 
 
 		 582 aa  265  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.98 
 
 		 632 aa  264  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.58 
 
 		 582 aa  265  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.58 
 
 		 582 aa  265  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  31.7 
 
 		 600 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  39.39 
 
 		 768 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.58 
 
 		 582 aa  265  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.78 
 
 		 578 aa  264  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.66 
 
 		 600 aa  264  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.78 
 
 		 578 aa  264  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.3 
 
 		 596 aa  264  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.79 
 
 		 586 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.03 
 
 		 590 aa  263  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  35.19 
 
 		 700 aa  263  8e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.13 
 
 		 586 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.13 
 
 		 586 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.13 
 
 		 586 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.67 
 
 		 629 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.81 
 
 		 582 aa  261  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  38.68 
 
 		 784 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2828  ABC transporter, ATPase subunit  33.15 
 
 		 618 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4984  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.39 
 
 		 624 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>