164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3254 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3173  hypothetical protein  62.11 
 
 		 494 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2623  hypothetical protein  66.32 
 
 		 496 aa  717    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2544  hypothetical protein  64.05 
 
 		 491 aa  699    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00544949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5432  hypothetical protein  67.36 
 
 		 492 aa  725    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1229  hypothetical protein  71.86 
 
 		 490 aa  771    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.159101 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0743  hypothetical protein  60.21 
 
 		 499 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0585282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1071  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  98.78 
 
 		 492 aa  1011    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2528  EvpB family type VI secretion protein  76.18 
 
 		 491 aa  823    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0534  hypothetical protein  60.08 
 
 		 760 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.897456  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2806  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  94.72 
 
 		 492 aa  979    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5594  hypothetical protein  67.36 
 
 		 491 aa  724    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0279  hypothetical protein  60.98 
 
 		 492 aa  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3225  EvpB family type VI secretion protein  65.44 
 
 		 496 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0239  hypothetical protein  73.13 
 
 		 491 aa  790    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0046  hypothetical protein  73.2 
 
 		 492 aa  783    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0387  EvpB family type VI secretion protein  79.11 
 
 		 493 aa  843    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43030  hypothetical protein  67.58 
 
 		 491 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1182  EvpB family type VI secretion protein  59.07 
 
 		 482 aa  636    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3732  hypothetical protein  76.39 
 
 		 493 aa  832    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0605  hypothetical protein  60.21 
 
 		 508 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000440  uncharacterized protein ImpC  67.29 
 
 		 491 aa  719    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338672  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0716  hypothetical protein  60.21 
 
 		 508 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3904  hypothetical protein  79.11 
 
 		 493 aa  843    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2124  hypothetical protein  60.21 
 
 		 499 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1110  type VI secretion protein, EvpB/family  71.86 
 
 		 490 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2026  hypothetical protein  60.21 
 
 		 499 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383781  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1123  putative type VI secretion protein VasR  65.15 
 
 		 491 aa  680    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1673  hypothetical protein  60.21 
 
 		 508 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3254  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  100 
 
 		 492 aa  1019    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0091  hypothetical protein  65.45 
 
 		 492 aa  717    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0030  hypothetical protein  77.57 
 
 		 492 aa  822    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.599961  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2126  hypothetical protein  66.74 
 
 		 496 aa  719    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1197  hypothetical protein  74.74 
 
 		 493 aa  790    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.73618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3614  hypothetical protein  66.53 
 
 		 491 aa  712    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0314  hypothetical protein  79.11 
 
 		 493 aa  843    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05862  hypothetical protein  66.67 
 
 		 491 aa  715    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0237  hypothetical protein  73.13 
 
 		 491 aa  790    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0869  hypothetical protein  59.62 
 
 		 508 aa  628  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0012  hypothetical protein  53.25 
 
 		 482 aa  536  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0624  hypothetical protein  45.58 
 
 		 525 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0350498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5265  hypothetical protein  46.02 
 
 		 515 aa  438  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2815  hypothetical protein  43.63 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1784  hypothetical protein  42.79 
 
 		 515 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.170054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0799  EvpB family type VI secretion protein  42.73 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.380485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0727  hypothetical protein  42.29 
 
 		 516 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2510  hypothetical protein  42.29 
 
 		 516 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0778  hypothetical protein  42.29 
 
 		 517 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0175  hypothetical protein  42.29 
 
 		 512 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.653266  hitchhiker  0.00000100045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2915  hypothetical protein  42.13 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.376798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3650  EvpB family type VI secretion protein  42.26 
 
 		 516 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.453281 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3124  hypothetical protein  41.69 
 
 		 512 aa  405  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0160  hypothetical protein  45.31 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.586065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02046  EvpB  41.41 
 
 		 498 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3260  EvpB family type VI secretion protein  40.43 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  42.17 
 
 		 496 aa  392  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  41.38 
 
 		 496 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000570497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  41.38 
 
 		 496 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  41.39 
 
 		 496 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  41.38 
 
 		 496 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  41.38 
 
 		 496 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  41.38 
 
 		 496 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  41.38 
 
 		 496 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000282714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  41.15 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  41.77 
 
 		 499 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  41.15 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  41.15 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  39.24 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000122545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4914  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  40.67 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000326238  normal  0.0140639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  41.07 
 
 		 496 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2509  EvpB family type VI secretion protein  41.68 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2765  EvpB family type VI secretion protein  41.98 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0505652  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3851  EvpB family type VI secretion protein  40.89 
 
 		 497 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2323  hypothetical protein  39.47 
 
 		 498 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0970803  normal  0.0167765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3099  hypothetical protein  41.77 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2623  hypothetical protein  41.77 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3908  EvpB family type VI secretion protein  42 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.38023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4954  hypothetical protein  40.63 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3407  hypothetical protein  41.48 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1477  hypothetical protein  42.33 
 
 		 499 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1682  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  41.4 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509952  normal  0.0159997 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1606  hypothetical protein  38.71 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128756  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0122  hypothetical protein  38.71 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0158  hypothetical protein  38.71 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0134  hypothetical protein  38.71 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26660  hypothetical protein  39.87 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930343  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0981  hypothetical protein  39.18 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6113  EvpB family type VI secretion protein  38.18 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.32673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34050  hypothetical protein  41.32 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  0.0910485 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2460  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  39.52 
 
 		 499 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0194  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  38.15 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1480  EvpB family type VI secretion protein  41.53 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2872  hypothetical protein  41.53 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2895  hypothetical protein  41.12 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1368  hypothetical protein  41.53 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2094  putative cytoplasmic protein  40.58 
 
 		 497 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3004  hypothetical protein  40.7 
 
 		 501 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4090  EvpB family type VI secretion protein  39.74 
 
 		 498 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000002005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3042  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.39 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0242  hypothetical protein  37.78 
 
 		 499 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0333  hypothetical protein  37.68 
 
 		 499 aa  362  9e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>