More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31620 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  89.68 
 
 
465 aa  821    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  929    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  63.96 
 
 
460 aa  561  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  64.72 
 
 
428 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  60.65 
 
 
451 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  60.71 
 
 
447 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  59.64 
 
 
444 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  58.7 
 
 
435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  57.49 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  57.49 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  57.25 
 
 
435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  47.1 
 
 
482 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  39.15 
 
 
562 aa  311  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 
558 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  39.55 
 
 
519 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  41.25 
 
 
734 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  30.73 
 
 
517 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  26.79 
 
 
585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  28.05 
 
 
513 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  31.72 
 
 
499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  33.57 
 
 
268 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  32.3 
 
 
290 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  34.2 
 
 
270 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  34.5 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  29.45 
 
 
512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  30.53 
 
 
290 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  35.62 
 
 
558 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  30.97 
 
 
272 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1170  OmpA family protein  30.91 
 
 
512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  33.33 
 
 
276 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  31.14 
 
 
272 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  32.88 
 
 
283 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  33.02 
 
 
285 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  32.16 
 
 
281 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  30.09 
 
 
272 aa  114  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  31 
 
 
271 aa  114  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  29.2 
 
 
271 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  32.19 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  31.31 
 
 
301 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  33.84 
 
 
280 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  30.7 
 
 
281 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  31.86 
 
 
270 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  30.09 
 
 
272 aa  111  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  28.88 
 
 
273 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  33.33 
 
 
267 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  29.84 
 
 
278 aa  109  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  29.91 
 
 
281 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  28.09 
 
 
273 aa  109  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  27.71 
 
 
278 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  28.71 
 
 
284 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  30.9 
 
 
274 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  31.33 
 
 
274 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  29.39 
 
 
272 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  29.15 
 
 
381 aa  106  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  33.17 
 
 
278 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  32.47 
 
 
272 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  32.89 
 
 
303 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  32.17 
 
 
264 aa  104  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  32.51 
 
 
323 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  30.56 
 
 
272 aa  104  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  29.84 
 
 
302 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  35.84 
 
 
278 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  29.15 
 
 
322 aa  103  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  32.03 
 
 
272 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.99 
 
 
218 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  31.33 
 
 
287 aa  103  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  32.03 
 
 
272 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.25 
 
 
272 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  29.91 
 
 
273 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  30.2 
 
 
322 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  30.37 
 
 
282 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  31.4 
 
 
323 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  29.61 
 
 
274 aa  100  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  33.33 
 
 
292 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  31.72 
 
 
302 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  29.06 
 
 
273 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  28.89 
 
 
285 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  31.6 
 
 
271 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  31.82 
 
 
323 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  31.82 
 
 
323 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  31.82 
 
 
323 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
273 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  31.03 
 
 
330 aa  98.2  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  31.82 
 
 
323 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.5 
 
 
299 aa  97.8  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  30.24 
 
 
332 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  30.29 
 
 
323 aa  97.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  30.24 
 
 
332 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  31.49 
 
 
281 aa  96.7  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  28.46 
 
 
332 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  28.09 
 
 
273 aa  96.3  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  28.69 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  31.58 
 
 
330 aa  96.3  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  29.2 
 
 
279 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  30.28 
 
 
274 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  30.33 
 
 
284 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  29.84 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  28.38 
 
 
277 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  30.17 
 
 
323 aa  94.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  29.27 
 
 
332 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.503358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>