More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_23610 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  100 
 
 
285 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  95.44 
 
 
285 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  70.98 
 
 
279 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  64.31 
 
 
277 aa  349  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  63.91 
 
 
293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  63.91 
 
 
292 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  64.29 
 
 
277 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  64.23 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  28.4 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  36.88 
 
 
320 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  36.27 
 
 
320 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  33.8 
 
 
308 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  39.92 
 
 
326 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  37.5 
 
 
300 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  35.78 
 
 
295 aa  99  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  29.59 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  35.12 
 
 
322 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  32.78 
 
 
305 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  36.53 
 
 
295 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  26.1 
 
 
308 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  28.5 
 
 
287 aa  92.4  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.13 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  27.51 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  30.86 
 
 
333 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  30.56 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  29.36 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  26.69 
 
 
284 aa  85.5  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  26.04 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  35.05 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  30.77 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  33.99 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  35.42 
 
 
326 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  31.02 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  35.78 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  26.09 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  25.12 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  25.23 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  30.2 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  35.61 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  35.1 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  29.19 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  32.86 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  24.23 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  32.47 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  32.87 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  28.76 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  29.86 
 
 
316 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  25.58 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
309 aa  58.9  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  30.13 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
257 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  30.57 
 
 
282 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  23.89 
 
 
267 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
361 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 
278 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
456 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  36.26 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  39.64 
 
 
255 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  30.67 
 
 
324 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
298 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  30.67 
 
 
324 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  30.67 
 
 
324 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 
322 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  30.67 
 
 
327 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  30.67 
 
 
324 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.86 
 
 
370 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 
276 aa  52.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.44 
 
 
254 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  41.86 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 
299 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  21.03 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  31.14 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  25 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  31.78 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  31.78 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  30.96 
 
 
397 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  37.62 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  31.06 
 
 
324 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  25.11 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
279 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  27.56 
 
 
304 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  36.26 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
291 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  23.92 
 
 
313 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  25.55 
 
 
253 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1334  hydrolase with alpha/beta fold  21.79 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.706412  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  27.65 
 
 
251 aa  49.3  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 
315 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  29.39 
 
 
314 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  23.75 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>