More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_09961 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  100 
 
 		 335 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  76.06 
 
 		 332 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  75.16 
 
 		 345 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  75.48 
 
 		 345 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  75.94 
 
 		 333 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  76.9 
 
 		 331 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  66.45 
 
 		 335 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  66.77 
 
 		 335 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  67.66 
 
 		 314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  66.67 
 
 		 320 aa  437  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  66.13 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  63.87 
 
 		 328 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6069  biotin synthase  62.58 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  64.75 
 
 		 337 aa  381  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  61.94 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  60.38 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  60.38 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4487  biotin synthase  60.97 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  57.06 
 
 		 333 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  58.93 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  56.33 
 
 		 339 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  55.81 
 
 		 375 aa  364  1e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  56.45 
 
 		 322 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  56.45 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  56.45 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  56.45 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  56.45 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  56.45 
 
 		 336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  58.36 
 
 		 320 aa  362  5.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  56.63 
 
 		 351 aa  362  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  58.82 
 
 		 330 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  56.45 
 
 		 339 aa  361  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  53.04 
 
 		 350 aa  361  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  56.31 
 
 		 360 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  52.85 
 
 		 364 aa  359  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  54.66 
 
 		 350 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  53.7 
 
 		 362 aa  359  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  56.31 
 
 		 361 aa  358  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  57.1 
 
 		 345 aa  358  9e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  56.09 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  53.75 
 
 		 350 aa  355  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  54.43 
 
 		 337 aa  355  7.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  53.53 
 
 		 356 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  53.53 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  54.63 
 
 		 352 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  53.87 
 
 		 352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  56.07 
 
 		 330 aa  352  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  54.63 
 
 		 352 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  56.77 
 
 		 339 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  56.77 
 
 		 339 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  56.77 
 
 		 339 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  53.89 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  52.56 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  56.03 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  53.89 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  55.06 
 
 		 346 aa  349  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  55.63 
 
 		 331 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  55.7 
 
 		 360 aa  349  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  54.75 
 
 		 346 aa  349  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  53.67 
 
 		 352 aa  348  9e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  54.75 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  54.75 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  54.75 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  53.89 
 
 		 351 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  54.75 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  54.75 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  54.75 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  54.75 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  56.13 
 
 		 339 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  54.84 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  53.58 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  53.89 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  55.03 
 
 		 349 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  56.45 
 
 		 339 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  55.99 
 
 		 345 aa  345  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  56.03 
 
 		 350 aa  345  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  54.84 
 
 		 352 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  55.52 
 
 		 340 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  55.81 
 
 		 339 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  54.4 
 
 		 359 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  56.03 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  54.4 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  54.31 
 
 		 354 aa  342  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2132  biotin synthase  54.89 
 
 		 342 aa  342  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  54.22 
 
 		 335 aa  342  8e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  54.19 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  53.87 
 
 		 346 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  51.1 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  53.23 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  51.94 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  53.87 
 
 		 346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  53.87 
 
 		 346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  53.87 
 
 		 346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3779  biotin synthase  55.7 
 
 		 353 aa  338  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195072  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  52.2 
 
 		 374 aa  338  7e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0150  biotin synthase  56.31 
 
 		 342 aa  338  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  53.35 
 
 		 354 aa  338  9e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  53.55 
 
 		 334 aa  338  9e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  52.58 
 
 		 345 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  52.16 
 
 		 350 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>