42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01061 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_01061  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  810    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.392097 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0177  radical SAM family protein  49.2 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.698116  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  28.25 
 
 		 356 aa  142  9e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  26.65 
 
 		 369 aa  109  9.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  24.87 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2164  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.295283  normal  0.13164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  21.88 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  28.08 
 
 		 409 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 468 aa  53.1  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  21.62 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  23.9 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  23.9 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 332 aa  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  21.46 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0883  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.66 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  33.33 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 574 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  30.34 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  23.73 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0858  Radical SAM domain protein  31.91 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.98 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  29.55 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.45 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  20.49 
 
 		 565 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.79 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  27.55 
 
 		 510 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.63 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.95 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 380 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  27.55 
 
 		 459 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>