111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_06081 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0582  hypothetical protein  92.66 
 
 		 327 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  97.55 
 
 		 327 aa  658    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06081  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 327 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06471  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  82.99 
 
 		 294 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0018  hypothetical protein  52.02 
 
 		 328 aa  328  7e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  51.88 
 
 		 328 aa  328  7e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0655453  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1016  hypothetical protein  46.27 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  46.58 
 
 		 339 aa  322  7e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18351  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  46.32 
 
 		 333 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.279534 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10701  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  47.99 
 
 		 333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.638537 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1087  hypothetical protein  40.81 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000930437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.91 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5160  NmrA family protein  34.27 
 
 		 318 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.31 
 
 		 315 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0116647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0770321  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.32 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.16 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 		 357 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  33.91 
 
 		 279 aa  52.8  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.18 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.85 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  27.12 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  27.12 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2297  GDP-D-mannose dehydratase, putative  24.22 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3293  WcbK  24.22 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.56 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0531  putative GDP-D-mannose dehydratase  24.22 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1069  putative GDP-D-mannose dehydratase  24.22 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3244  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  24.22 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3279  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  24.22 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.409914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2175  putative GDP-D-mannose dehydratase  24.22 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  21.2 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556189  normal  0.226818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.75 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.91 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  24.6 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  27.12 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 		 372 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1007  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  24.59 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197321  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  23.56 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0684  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  20.87 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.05 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.15 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  27.64 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  26.27 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.88 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.95 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.87 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.79 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.46 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  23.73 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.6 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  23.87 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0266  hypothetical protein  26.47 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  23.87 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2103  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.12 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2324  VI polysaccharide biosynthesis protein vipB/tviC  25.16 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2502  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.12 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  23.73 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.31 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3414  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.8 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.2 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.44 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.87 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  26.27 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.14 
 
 		 340 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  22.58 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  25.93 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2213  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  23.73 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  26.14 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.14 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  28.1 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>