More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_01881 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_01881  NifS-like aminotransferase class-V  100 
 
 
390 aa  799    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27201  NifS-like aminotransferase class-V  58.29 
 
 
402 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02451  NifS-like aminotransferase class-V  59.16 
 
 
382 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1538  NifS-like aminotransferase class-V  58.9 
 
 
382 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2429  NifS-like aminotransferase class-V  57.18 
 
 
354 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0534136  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01881  NifS-like aminotransferase class-V  53.02 
 
 
381 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01901  NifS-like aminotransferase class-V  53.54 
 
 
381 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01991  NifS-like aminotransferase class-V  52.76 
 
 
381 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.117256  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2109  NifS-like aminotransferase class-V  53.8 
 
 
354 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0172  nifS-like aminotransferase class-V  51.18 
 
 
381 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  46.48 
 
 
388 aa  341  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  45.64 
 
 
389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  42.56 
 
 
389 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.59 
 
 
388 aa  316  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  43.81 
 
 
388 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  44.94 
 
 
422 aa  312  5.999999999999999e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  42.08 
 
 
405 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  43.3 
 
 
388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  42.34 
 
 
405 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  42.08 
 
 
407 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  42.08 
 
 
421 aa  308  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  40.67 
 
 
403 aa  308  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  43.29 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  41.97 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  40.67 
 
 
436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  40.67 
 
 
436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  42.45 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  40.67 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  41.71 
 
 
404 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  42.08 
 
 
405 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  42.08 
 
 
430 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  43.75 
 
 
404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  43.75 
 
 
404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  43.78 
 
 
404 aa  305  6e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  43.12 
 
 
395 aa  305  7e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  43.49 
 
 
404 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  43.49 
 
 
404 aa  304  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  43.49 
 
 
404 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  43.49 
 
 
404 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  43.49 
 
 
404 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  43.75 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  43.75 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  43.75 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  43.75 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  43.75 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  43.75 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  43.75 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  43.75 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  43.75 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  43.75 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  42.97 
 
 
404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  41.6 
 
 
406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  42.86 
 
 
392 aa  303  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  42.38 
 
 
406 aa  302  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  42.82 
 
 
408 aa  302  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  43.49 
 
 
404 aa  301  9e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  41.56 
 
 
406 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.89 
 
 
394 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  42.6 
 
 
406 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  41.71 
 
 
404 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  41.93 
 
 
404 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.52 
 
 
388 aa  299  6e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  40.62 
 
 
407 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  43.38 
 
 
410 aa  299  6e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  42.19 
 
 
404 aa  298  8e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  43.26 
 
 
404 aa  298  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1710  hypothetical protein  43.15 
 
 
387 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  39.27 
 
 
405 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  43.01 
 
 
404 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  41.41 
 
 
406 aa  297  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  40.78 
 
 
406 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  43.78 
 
 
404 aa  297  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  40.51 
 
 
407 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  41.36 
 
 
407 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  42.12 
 
 
405 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  43.78 
 
 
404 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  43.78 
 
 
404 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  41.36 
 
 
407 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  41.36 
 
 
407 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  41.36 
 
 
407 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  40.26 
 
 
407 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  41.36 
 
 
407 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.88 
 
 
392 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  44.3 
 
 
404 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  40 
 
 
407 aa  296  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  41.1 
 
 
405 aa  296  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  40.26 
 
 
407 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  41.04 
 
 
406 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  44.56 
 
 
404 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  44.42 
 
 
402 aa  295  7e-79  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  40.84 
 
 
407 aa  295  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  44.3 
 
 
404 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  44.04 
 
 
404 aa  295  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  44.3 
 
 
404 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  40.26 
 
 
407 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  42.49 
 
 
404 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  40.52 
 
 
406 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  40.26 
 
 
407 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  40.26 
 
 
407 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  40.26 
 
 
407 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>