43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2931 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2931  hypothetical protein  100 
 
 		 766 aa  1507    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0187375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0793  hypothetical protein  28.07 
 
 		 827 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.526313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0453  hypothetical protein  26.08 
 
 		 828 aa  212  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4224  hypothetical protein  26.52 
 
 		 821 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.965892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  28.61 
 
 		 818 aa  183  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2865  hypothetical protein  30.89 
 
 		 819 aa  183  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0150  spermidine synthase-like  26.52 
 
 		 812 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3330  hypothetical protein  28.02 
 
 		 783 aa  111  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0454731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2791  hypothetical protein  24.88 
 
 		 806 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2180  hypothetical protein  29.04 
 
 		 889 aa  73.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.786018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  35.51 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5063  Spermidine synthase-like protein  23.29 
 
 		 692 aa  62.4  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1079 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  26 
 
 		 1078 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  25.11 
 
 		 1078 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  28.57 
 
 		 291 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  30.99 
 
 		 302 aa  53.9  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  28.67 
 
 		 296 aa  52.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  28.67 
 
 		 293 aa  52  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  28.37 
 
 		 295 aa  51.2  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  30.08 
 
 		 284 aa  49.3  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  26.32 
 
 		 287 aa  48.9  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  31.52 
 
 		 1040 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  22.65 
 
 		 991 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  28.57 
 
 		 982 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  23.76 
 
 		 782 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  27.39 
 
 		 310 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  26.32 
 
 		 287 aa  47  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  26.17 
 
 		 281 aa  45.8  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  26.32 
 
 		 286 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  27.07 
 
 		 286 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  27.07 
 
 		 286 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0336  spermine synthase  26.28 
 
 		 235 aa  45.8  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  28.57 
 
 		 983 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  26.32 
 
 		 287 aa  45.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  26.06 
 
 		 277 aa  45.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  26.12 
 
 		 290 aa  44.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  29.27 
 
 		 283 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  29.27 
 
 		 283 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0528  methyltransferase  26.02 
 
 		 398 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000817153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  26.32 
 
 		 286 aa  44.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  23.48 
 
 		 275 aa  44.3  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  26.87 
 
 		 277 aa  44.3  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>