More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2731 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2731  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  870    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1968  seryl-tRNA synthetase  56.57 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.355575  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0316  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 423 aa  411  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.317147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5630  seryl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00319039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0216  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3604  seryl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0847  seryl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 420 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3818  seryl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0225862  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0415  seryl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 426 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 422 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 424 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  47 
 
 		 423 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 424 aa  383  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1519  hypothetical protein  46.26 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.833428 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  47 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1426  seryl-tRNA synthetase  47 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0695  seryl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0194542  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 426 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0734  seryl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 427 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 425 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 425 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 423 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 427 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 428 aa  362  7.0000000000000005e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0931  seryl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 431 aa  362  9e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 421 aa  359  5e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 421 aa  359  5e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 427 aa  359  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3523  seryl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 425 aa  359  6e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 425 aa  358  7e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03775  seryl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.64354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 430 aa  355  6.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 427 aa  355  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 413 aa  353  2e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  44.6 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_516  seryl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 413 aa  352  5e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 424 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 431 aa  350  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 413 aa  349  5e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 425 aa  345  7e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1392  seryl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 425 aa  342  5.999999999999999e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4028  seryl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 443 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>