More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1683 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
385 aa  759    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 
372 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
445 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  42.29 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
440 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  36.4 
 
 
413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  37.68 
 
 
422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
397 aa  146  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
401 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
394 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  37.25 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  33.33 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
402 aa  130  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  41.12 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.17 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.39 
 
 
380 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
403 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
412 aa  122  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  37.39 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.87 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  36.29 
 
 
422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  33.21 
 
 
407 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.12 
 
 
406 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.61 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  31.53 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  36.64 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
398 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
405 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
468 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.54 
 
 
392 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  35.66 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
508 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  37.81 
 
 
462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  37.32 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  33.6 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  34.62 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  38.42 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  31.96 
 
 
402 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  38.99 
 
 
367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  32.32 
 
 
393 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  32.54 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  31.03 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  34.82 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  39.25 
 
 
430 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  35.47 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  40.1 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  35.12 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.57 
 
 
370 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
398 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  35.55 
 
 
402 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  37.5 
 
 
457 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  31.49 
 
 
378 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  35.88 
 
 
428 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  39.8 
 
 
357 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1768  histidine kinase  34.7 
 
 
666 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.686261  normal  0.0755696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
468 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  34.5 
 
 
442 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  37.56 
 
 
376 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
412 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  27.56 
 
 
376 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  27.56 
 
 
376 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  37.1 
 
 
412 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  31.13 
 
 
400 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
438 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  35.18 
 
 
387 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  33.91 
 
 
423 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  32.65 
 
 
417 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
382 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  27.24 
 
 
376 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  35.83 
 
 
397 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
390 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.66 
 
 
378 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
439 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  31.36 
 
 
393 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.04 
 
 
424 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
391 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.03 
 
 
456 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  31.56 
 
 
399 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  37.1 
 
 
419 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
404 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
372 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
398 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
359 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 
359 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
359 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4943  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
439 aa  103  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  28.89 
 
 
431 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  33.64 
 
 
402 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  33.03 
 
 
393 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  27.31 
 
 
595 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
546 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>