37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0585 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0585  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2252  hypothetical protein  39.75 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.303114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6234  hypothetical protein  28.96 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170418  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2749  hypothetical protein  34.55 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.594508  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94311  predicted protein  24.86 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.320101 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1434  hypothetical protein  28.18 
 
 
273 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  26.14 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  38.33 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0933  hypothetical protein  29.94 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 
213 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5176  family 2 glycosyl transferase  28.89 
 
 
434 aa  48.9  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.634801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.21 
 
 
629 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  23.53 
 
 
661 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  27.66 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1141  hypothetical protein  26.8 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  32.61 
 
 
865 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
754 aa  45.4  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  22.96 
 
 
734 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3620  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  34.65 
 
 
435 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
883 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 
632 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
754 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26 
 
 
612 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.8 
 
 
3145 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
878 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
1106 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
685 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1076  hypothetical protein  26.92 
 
 
230 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  30.09 
 
 
529 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34 
 
 
598 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.57 
 
 
810 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1956  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 
271 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
391 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
362 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.33 
 
 
624 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>