39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0458 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0458  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1087 aa  2209    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.926775  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0456  TPR repeat-containing protein  46.25 
 
 		 1103 aa  498  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.713819  normal  0.332791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 673 aa  93.2  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1049 aa  65.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 1162 aa  63.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  45.65 
 
 		 1288 aa  60.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  28.5 
 
 		 546 aa  59.7  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  27.66 
 
 		 426 aa  57.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0080  hypothetical protein  24.64 
 
 		 300 aa  56.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  33.66 
 
 		 377 aa  53.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  25.43 
 
 		 621 aa  53.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0206  hypothetical protein  38.55 
 
 		 333 aa  52.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0200054 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1954  hypothetical protein  24.92 
 
 		 348 aa  52.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.222672  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  37.04 
 
 		 591 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 357 aa  49.7  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  35.14 
 
 		 395 aa  49.3  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 1061 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  28.16 
 
 		 331 aa  48.9  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  35.14 
 
 		 394 aa  48.9  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  28.16 
 
 		 331 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 357 aa  48.5  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  29.41 
 
 		 832 aa  48.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  24 
 
 		 331 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  35.14 
 
 		 394 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2758  hypothetical protein  27.1 
 
 		 325 aa  47  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  22.17 
 
 		 267 aa  47.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 934 aa  47.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  30.92 
 
 		 340 aa  46.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 767 aa  46.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  27.01 
 
 		 331 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  21.79 
 
 		 597 aa  45.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 479 aa  44.7  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000170755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  27.87 
 
 		 546 aa  44.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.64 
 
 		 1694 aa  44.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.93 
 
 		 293 aa  44.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  25 
 
 		 219 aa  44.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 219 aa  44.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 219 aa  44.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 219 aa  44.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>