More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32688 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  73.04 
 
 
413 aa  634    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  73.77 
 
 
413 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  73.84 
 
 
413 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  100 
 
 
417 aa  858    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  73.57 
 
 
409 aa  628  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  75.76 
 
 
415 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  71.81 
 
 
413 aa  625  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  70.96 
 
 
413 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  71.11 
 
 
420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  71.97 
 
 
411 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  70.07 
 
 
417 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  69.83 
 
 
417 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  69.19 
 
 
416 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  69.7 
 
 
418 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2418  tryptophan synthase subunit beta  70.34 
 
 
418 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27051  tryptophan synthase subunit beta  70.94 
 
 
421 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  69.06 
 
 
414 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  69.06 
 
 
414 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  68.92 
 
 
414 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  68.81 
 
 
414 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.9 
 
 
409 aa  542  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 
405 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  66.08 
 
 
405 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  67.69 
 
 
402 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  66.08 
 
 
405 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  65.25 
 
 
410 aa  534  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  66.08 
 
 
405 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  65.82 
 
 
402 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  65.49 
 
 
406 aa  529  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  65.23 
 
 
399 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  65.23 
 
 
399 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  65.08 
 
 
409 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  64.5 
 
 
401 aa  524  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  64 
 
 
404 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  62.87 
 
 
411 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  65.16 
 
 
410 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  63.48 
 
 
406 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 
409 aa  523  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.71 
 
 
409 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  64.07 
 
 
409 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  63.84 
 
 
409 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  62.75 
 
 
409 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 
418 aa  518  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  63.84 
 
 
409 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  63.22 
 
 
419 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  62.31 
 
 
397 aa  519  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  65.9 
 
 
395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 
397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  64.12 
 
 
397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1031  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 
410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466116  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  63.43 
 
 
410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  64.25 
 
 
402 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 
397 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 
399 aa  512  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 
397 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  63.09 
 
 
405 aa  511  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  62.62 
 
 
403 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  61.25 
 
 
406 aa  512  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 
397 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 
397 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  62.75 
 
 
404 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 
397 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 
397 aa  511  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  64.32 
 
 
399 aa  514  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 
397 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  63.32 
 
 
394 aa  512  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 
399 aa  512  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 
391 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  63.32 
 
 
408 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 
397 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0147  tryptophan synthase subunit beta  62.1 
 
 
417 aa  511  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 
397 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 
404 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  61.79 
 
 
405 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 
397 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  61.61 
 
 
406 aa  511  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  62.19 
 
 
406 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  62.66 
 
 
396 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  62.81 
 
 
410 aa  514  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  63.61 
 
 
397 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 
397 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 
403 aa  511  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  61.62 
 
 
397 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  61.62 
 
 
397 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  61.62 
 
 
397 aa  511  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 
396 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 
397 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  62 
 
 
406 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.62 
 
 
397 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 
398 aa  510  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 
403 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  61.62 
 
 
397 aa  511  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  61.75 
 
 
406 aa  508  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  61.75 
 
 
406 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 
397 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 
397 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 
411 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  63.87 
 
 
397 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  63.77 
 
 
405 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  61 
 
 
422 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>