More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_12087 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  100 
 
 
340 aa  700    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  57.72 
 
 
356 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.97 
 
 
355 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  57.14 
 
 
367 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  55.28 
 
 
345 aa  363  3e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.9 
 
 
340 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.28 
 
 
355 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.59 
 
 
340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.96 
 
 
361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.55 
 
 
356 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  49.85 
 
 
369 aa  339  4e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.07 
 
 
351 aa  334  2e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.98 
 
 
356 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.99 
 
 
351 aa  332  7.000000000000001e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18821  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.76 
 
 
359 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1012  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.46 
 
 
359 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.18 
 
 
347 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16851  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.95 
 
 
348 aa  289  6e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1574  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.65 
 
 
348 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16611  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.04 
 
 
348 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.785393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  46.85 
 
 
349 aa  278  9e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  46.5 
 
 
351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.02 
 
 
367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.25 
 
 
341 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.16 
 
 
386 aa  255  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.5 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.73 
 
 
349 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  41.18 
 
 
357 aa  252  7e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  42.99 
 
 
348 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  42.38 
 
 
353 aa  248  8e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  0.0000000842526 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  40.12 
 
 
356 aa  248  8e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.54 
 
 
342 aa  248  9e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  43.57 
 
 
408 aa  247  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  40.66 
 
 
351 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.18 
 
 
347 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.3 
 
 
347 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  42.94 
 
 
350 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  41.72 
 
 
344 aa  245  6.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.37 
 
 
358 aa  245  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  46.98 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07736  hypothetical protein  40.55 
 
 
346 aa  243  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  43.24 
 
 
360 aa  242  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  42.59 
 
 
342 aa  242  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  42.69 
 
 
369 aa  242  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  43.11 
 
 
344 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.34 
 
 
368 aa  240  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.24 
 
 
343 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.74 
 
 
389 aa  240  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.41 
 
 
362 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1602  radical SAM enzyme, Cfr family  44.62 
 
 
363 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.113295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1930  radical SAM enzyme, Cfr family  44.62 
 
 
362 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.23 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  41.64 
 
 
349 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.15 
 
 
343 aa  238  8e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  43.71 
 
 
392 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.34 
 
 
362 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.34 
 
 
362 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.34 
 
 
362 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.34 
 
 
362 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.34 
 
 
362 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.34 
 
 
362 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  43.84 
 
 
354 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.34 
 
 
362 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  44.58 
 
 
359 aa  237  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  43.16 
 
 
382 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.21 
 
 
359 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.48 
 
 
348 aa  236  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.04 
 
 
362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1782  radical SAM protein  39.33 
 
 
349 aa  235  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.04 
 
 
362 aa  235  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  41.99 
 
 
371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  47.29 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1657  radical SAM enzyme, Cfr family  42.48 
 
 
401 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33058  normal  0.466299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  44.27 
 
 
382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.31 
 
 
347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.32 
 
 
349 aa  233  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.16 
 
 
344 aa  232  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  42.38 
 
 
378 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  43.67 
 
 
381 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.84 
 
 
362 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.66 
 
 
358 aa  230  3e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3089  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.16 
 
 
360 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.929572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.94 
 
 
363 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  43.5 
 
 
375 aa  229  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  42.73 
 
 
348 aa  228  9e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  43.04 
 
 
382 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1716  radical SAM protein  42.33 
 
 
401 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.92 
 
 
364 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1780  hypothetical protein  42.33 
 
 
406 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.92 
 
 
364 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.41 
 
 
340 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  42.68 
 
 
382 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  41.95 
 
 
372 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  42.77 
 
 
364 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.23 
 
 
364 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.67 
 
 
361 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  43.45 
 
 
376 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  42.68 
 
 
382 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  39.83 
 
 
358 aa  226  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14130  radical SAM enzyme, Cfr family  37.35 
 
 
351 aa  227  3e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>