71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1960 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  143  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1138  hypothetical protein  49.28 
 
 		 70 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  52.38 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  49.28 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  54.55 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  54.39 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2797  hypothetical protein  49.18 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000554604  hitchhiker  0.00000544866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  47.37 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0833  hypothetical protein  51.85 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  46.43 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  50.91 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  46.77 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  43.55 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16860  hypothetical protein  43.1 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  45.9 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  38.89 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  38.71 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  40.32 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  40.68 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  48.89 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  36.49 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  44.62 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  40.32 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  44.62 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1072  hypothetical protein  42.37 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  38.71 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  40.32 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  38.71 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  40 
 
 		 252 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  38.71 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  45.28 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1909  hypothetical protein  41.38 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  48.08 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  38.71 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  46.81 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  40.32 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  44.23 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  37.29 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1943  hypothetical protein  45.28 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.605997  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0069  hypothetical protein  37.93 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1885  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  42.55 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  46.81 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  38.98 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  37.29 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  43.75 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  43.75 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  46.94 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  38.98 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  35.59 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  35.59 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  35.59 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  35.59 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  35.59 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  38.6 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  35.59 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  37.7 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  35.59 
 
 		 108 aa  40  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 73 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  33.9 
 
 		 91 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>