More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1251 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
566 aa  1167    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 
562 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  51 
 
 
562 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 
562 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  51 
 
 
562 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  51 
 
 
562 aa  571  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  51 
 
 
562 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 
562 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
566 aa  569  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
562 aa  565  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
562 aa  565  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  51 
 
 
562 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
565 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
565 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
564 aa  541  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
563 aa  536  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
565 aa  532  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
563 aa  531  1e-149  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
566 aa  516  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
564 aa  512  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
624 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
563 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
580 aa  507  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
562 aa  503  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
565 aa  491  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 
433 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
640 aa  405  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
574 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
572 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
613 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
571 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
591 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
603 aa  380  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.908762 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  32.69 
 
 
650 aa  353  5.9999999999999994e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
585 aa  346  5e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
581 aa  331  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  31.44 
 
 
622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
581 aa  325  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 
576 aa  323  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 
581 aa  319  9e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
581 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
581 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
581 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
581 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
581 aa  317  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
579 aa  317  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
581 aa  317  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
581 aa  316  6e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
581 aa  316  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
581 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
581 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
578 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
581 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
582 aa  313  6.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
574 aa  310  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
585 aa  309  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
578 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
578 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
576 aa  306  9.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
581 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 
578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
577 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
577 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
590 aa  303  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
577 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
577 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
577 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 
578 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
577 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  34.16 
 
 
577 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
579 aa  302  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 
579 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
577 aa  302  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 
581 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
577 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
577 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
577 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
577 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
577 aa  300  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
577 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
577 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 
577 aa  299  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
576 aa  299  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 
576 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
576 aa  296  5e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
576 aa  296  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
590 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
577 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
576 aa  294  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 
576 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
576 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 
577 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
598 aa  293  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
576 aa  293  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 
577 aa  293  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
576 aa  292  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
572 aa  292  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
575 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
577 aa  291  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>