More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4137 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4137  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 554 aa  1121    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  46.52 
 
 		 545 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3146  AMP-dependent synthetase and ligase  44.12 
 
 		 533 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  40.71 
 
 		 538 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  38.49 
 
 		 538 aa  356  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  38.56 
 
 		 546 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  39.74 
 
 		 544 aa  353  4e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  39.29 
 
 		 540 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  38.68 
 
 		 546 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 		 566 aa  350  3e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  38.49 
 
 		 546 aa  351  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 541 aa  348  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  38.58 
 
 		 552 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  38.49 
 
 		 544 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  38.91 
 
 		 540 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  38.91 
 
 		 540 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  38.27 
 
 		 552 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  38.73 
 
 		 552 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 		 1043 aa  343  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  37.79 
 
 		 549 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  38.18 
 
 		 549 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  37.83 
 
 		 560 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  36.8 
 
 		 550 aa  339  9e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 		 551 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  37.48 
 
 		 572 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  37.31 
 
 		 552 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 566 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  38.18 
 
 		 549 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  36.65 
 
 		 549 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  34.18 
 
 		 605 aa  335  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  36.3 
 
 		 560 aa  334  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  36.04 
 
 		 547 aa  333  4e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 530 aa  333  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 558 aa  333  7.000000000000001e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  38 
 
 		 546 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  36.87 
 
 		 564 aa  331  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 542 aa  330  3e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  36.72 
 
 		 549 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  35.91 
 
 		 574 aa  329  6e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  37.55 
 
 		 547 aa  329  7e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  34.52 
 
 		 587 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  36.76 
 
 		 578 aa  326  6e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  36.85 
 
 		 570 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  36.85 
 
 		 570 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  36.85 
 
 		 570 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.41 
 
 		 592 aa  325  1e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 571 aa  325  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 562 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  36.07 
 
 		 565 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 566 aa  324  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  37.09 
 
 		 576 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  36.23 
 
 		 570 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 843 aa  324  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  35.39 
 
 		 539 aa  323  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 		 563 aa  323  6e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  37.4 
 
 		 552 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  36.46 
 
 		 564 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  36.06 
 
 		 570 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 558 aa  322  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  36.62 
 
 		 574 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 539 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  35.92 
 
 		 570 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  36.23 
 
 		 568 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  37.18 
 
 		 549 aa  320  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 		 542 aa  320  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  36.85 
 
 		 570 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  37.18 
 
 		 561 aa  319  7e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 566 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  35.52 
 
 		 548 aa  319  9e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 		 550 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 554 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  34.46 
 
 		 584 aa  317  3e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  34.66 
 
 		 576 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  35.38 
 
 		 568 aa  317  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  35.99 
 
 		 548 aa  316  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  35.92 
 
 		 571 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  36.28 
 
 		 579 aa  316  7e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  36.04 
 
 		 576 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  35.56 
 
 		 571 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  35.97 
 
 		 576 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  35.97 
 
 		 576 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  35.97 
 
 		 576 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  36.87 
 
 		 576 aa  312  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  35.97 
 
 		 570 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  36.48 
 
 		 550 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  35.77 
 
 		 576 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  35.77 
 
 		 564 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  34.46 
 
 		 550 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  35.15 
 
 		 557 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  35.97 
 
 		 576 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  35.97 
 
 		 576 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  34.31 
 
 		 560 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  34.54 
 
 		 579 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  34.73 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  33.83 
 
 		 596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  34.98 
 
 		 573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.97 
 
 		 828 aa  307  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  35.53 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>