34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2393 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2393  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  60 
 
 		 2851 aa  58.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  60.98 
 
 		 2914 aa  55.8  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  55.77 
 
 		 1426 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  59.52 
 
 		 366 aa  51.2  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  60.38 
 
 		 582 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  63.41 
 
 		 451 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  63.41 
 
 		 437 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  63.41 
 
 		 437 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  40.66 
 
 		 439 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  65.85 
 
 		 434 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  40.66 
 
 		 437 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  64.29 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0923  triple helix repeat-containing collagen  35.42 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0470667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  60 
 
 		 689 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  59.52 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  39.62 
 
 		 444 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  63.64 
 
 		 400 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  51.56 
 
 		 158 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  63.41 
 
 		 645 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  51.56 
 
 		 221 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  58.54 
 
 		 438 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  62.5 
 
 		 344 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  57.5 
 
 		 580 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26040  hypothetical protein  64.52 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.419278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  54 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0939  Collagen triple helix repeat protein  34.74 
 
 		 194 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0376709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  65 
 
 		 839 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  58.97 
 
 		 436 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  53.33 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2459  Collagen triple helix repeat protein  58.54 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1937  triple helix repeat-containing collagen  56.52 
 
 		 219 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  52.5 
 
 		 523 aa  42.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  53.57 
 
 		 953 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>