164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2138 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2138  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
246 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6491  putative class II aldolase/adducin-like protein  32.89 
 
 
264 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4371  class II aldolase/adducin-like  32.77 
 
 
276 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717848  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4349  class II aldolase/adducin family protein  31.65 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01660  decarboxylase protein  35.11 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552729  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3551  HCOMODA decarboxylase (CmtD)  30.48 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161109  normal  0.205223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1327  class II aldolase/adducin family protein  26.09 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2893  class II aldolase/adducin family protein  36.36 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.582162 
 
 
-
 
NC_002978  WD0208  hypothetical protein  24.8 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.720455  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1648  class II aldolase/adducin family protein  28.99 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  31.82 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  30.54 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  27.78 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  25.35 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1062  class II aldolase/adducin family protein  33.52 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138135  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  26.64 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4368  class II aldolase/adducin family protein  28.19 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.5996  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  31.28 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  27.27 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  28.93 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  31.76 
 
 
260 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  31.36 
 
 
258 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0873  class II aldolase/adducin-like  25.32 
 
 
242 aa  55.1  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.137021  normal  0.149254 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0849  hypothetical protein  27.5 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  30.51 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  34.38 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  26.99 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1684  class II aldolase/adducin-like protein  28.75 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  25.93 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1713  class II aldolase/adducin family protein  28.75 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0543  class II aldolase/adducin family protein  28.75 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1657  class II aldolase/adducin family protein  28.75 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0540  class II aldolase/adducin family protein  28.75 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0622  class II aldolase/adducin family protein  28.75 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  23.94 
 
 
216 aa  52.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  28.17 
 
 
214 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  29.08 
 
 
252 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  29.61 
 
 
222 aa  52.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  24.88 
 
 
214 aa  52.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  26.77 
 
 
215 aa  52  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  25 
 
 
251 aa  52  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  28.22 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  29.6 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  27.78 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  30.63 
 
 
427 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  29.79 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  31.28 
 
 
201 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  29.46 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  27.23 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  31.34 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  27.14 
 
 
298 aa  49.7  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  26.5 
 
 
212 aa  50.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  29.38 
 
 
252 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06100  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  30.22 
 
 
228 aa  48.9  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.214658  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  27.27 
 
 
261 aa  48.5  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  24.29 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  26.67 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  26.77 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  28.46 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  29.69 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  25.74 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5842  class II aldolase/adducin family protein  29.52 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  22.92 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  27.03 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  29.06 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  27.61 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  24.63 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  29.13 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  30.85 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  29.13 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  24.63 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  24.63 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  28.95 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  25.91 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  28.67 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  27.18 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  28.95 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  29.56 
 
 
259 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  27.98 
 
 
260 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  25.23 
 
 
218 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  27.86 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  26.29 
 
 
262 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  27.67 
 
 
258 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5445  class II aldolase/adducin-like protein  29.07 
 
 
321 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.618582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  30.14 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  27.98 
 
 
260 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  29.79 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  28.23 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  25.71 
 
 
238 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  32.03 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  27.64 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  27.51 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  24.26 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  23.91 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  24.14 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  24.26 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  24.14 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  24.14 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  24.14 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.46 
 
 
214 aa  45.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>