29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2757 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2757  fibronectin, type III  100 
 
 		 490 aa  1015    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.48041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  38.1 
 
 		 3507 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  38.75 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 673 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  34.57 
 
 		 995 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  37.8 
 
 		 480 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.97 
 
 		 6885 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  41.46 
 
 		 4433 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  36.26 
 
 		 2334 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  35 
 
 		 1042 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  26.62 
 
 		 9585 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  34.88 
 
 		 2286 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  40.32 
 
 		 2068 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  34.52 
 
 		 1160 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  32.93 
 
 		 743 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  32.5 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  31.91 
 
 		 670 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  37.88 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  34.15 
 
 		 608 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  32.2 
 
 		 999 aa  47  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  45.71 
 
 		 771 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  32.47 
 
 		 841 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  37.66 
 
 		 861 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  28.57 
 
 		 825 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  32.53 
 
 		 853 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  31.62 
 
 		 997 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  32.03 
 
 		 1735 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  31.03 
 
 		 527 aa  44.3  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  34.41 
 
 		 1363 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>