71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1188 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  100 
 
 		 351 aa  707    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  32.31 
 
 		 348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  34.68 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  28.17 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  31.79 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  32.55 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  30.79 
 
 		 356 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  35.66 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2133  hypothetical protein  32.14 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2115  hypothetical protein  32.14 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0320662  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5962  hypothetical protein  32.14 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5421  hypothetical protein  31.47 
 
 		 358 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  28.93 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  35.88 
 
 		 372 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  28.11 
 
 		 359 aa  96.3  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1447  hypothetical protein  31.58 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944051 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2025  hypothetical protein  34.13 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.604471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2152  hypothetical protein  34.13 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0374202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  30.63 
 
 		 306 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1155  hypothetical protein  33.65 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0968736  normal  0.0377322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  29.33 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  33.85 
 
 		 541 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  30.07 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  35.26 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2204  hypothetical protein  35.26 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  35.26 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  35.26 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1477  hypothetical protein  35.26 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  32.37 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1697  hypothetical protein  33.85 
 
 		 407 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  29.09 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1469  hypothetical protein  35.76 
 
 		 326 aa  87.4  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  29.75 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  36.99 
 
 		 366 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  31.2 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2568  hypothetical protein  32.99 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133782  normal  0.0201135 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  34.32 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  34.32 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0488  hypothetical protein  35.88 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3701  hypothetical protein  26.87 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  49.15 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2399  putative signal peptide protein  31.61 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  31.78 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3423  hypothetical protein  25.99 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2750  putative signal peptide protein  30.5 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2757  hypothetical protein  25.81 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1757  hypothetical protein  24.2 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.870085  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5405  hypothetical protein  24.62 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.562328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.02 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0635  hypothetical protein  29.47 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0475  hypothetical protein  29.47 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.94 
 
 		 399 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1013  hypothetical protein  28.22 
 
 		 362 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3257  hypothetical protein  30.51 
 
 		 316 aa  52.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.3 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.83 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.68 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  33.02 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1209  hypothetical protein  28.36 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  40.68 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1986  hypothetical protein  31.5 
 
 		 452 aa  46.6  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00012685  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  30.67 
 
 		 383 aa  46.2  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25.34 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  37.1 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  24.86 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  30.14 
 
 		 405 aa  42.7  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  41.38 
 
 		 402 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>