109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1158 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1158  type I restriction-modification system, M subunit  100 
 
 		 129 aa  271  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  74.11 
 
 		 527 aa  173  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  66.37 
 
 		 526 aa  159  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  57.89 
 
 		 499 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  66.22 
 
 		 505 aa  97.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  54.67 
 
 		 506 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  52 
 
 		 495 aa  87  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1127  N-6 DNA methylase  40.54 
 
 		 302 aa  87  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  48.65 
 
 		 526 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  49.33 
 
 		 501 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  47.31 
 
 		 494 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  36.45 
 
 		 527 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  48.89 
 
 		 871 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  51.11 
 
 		 827 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  29.09 
 
 		 814 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  46.67 
 
 		 809 aa  57  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  29.09 
 
 		 847 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  51.22 
 
 		 808 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  51.22 
 
 		 810 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  48.78 
 
 		 810 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  51.22 
 
 		 814 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  46.34 
 
 		 799 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  41.18 
 
 		 503 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  32.89 
 
 		 492 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  37.7 
 
 		 496 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  30.93 
 
 		 500 aa  50.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  40.3 
 
 		 513 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  38.98 
 
 		 500 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  41.3 
 
 		 544 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  38.78 
 
 		 508 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  37.29 
 
 		 498 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32 
 
 		 508 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  45.83 
 
 		 525 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  37.93 
 
 		 519 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  38.33 
 
 		 505 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  46.15 
 
 		 540 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  35 
 
 		 511 aa  48.9  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35 
 
 		 549 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2619  type I restriction-modification system, M subunit  37.5 
 
 		 584 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  37.74 
 
 		 576 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  38.6 
 
 		 498 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  43.59 
 
 		 564 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  45.95 
 
 		 525 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  36.36 
 
 		 537 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  36.36 
 
 		 537 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  45 
 
 		 543 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  45 
 
 		 541 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  46.15 
 
 		 503 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  39.13 
 
 		 548 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  33.85 
 
 		 574 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  39.58 
 
 		 540 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  36.84 
 
 		 814 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  38.46 
 
 		 523 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  33.93 
 
 		 523 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  42.5 
 
 		 540 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  43.9 
 
 		 799 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  33.93 
 
 		 508 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  46.34 
 
 		 516 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  37.04 
 
 		 519 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  42.5 
 
 		 544 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  33.93 
 
 		 574 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  34.29 
 
 		 908 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  36.84 
 
 		 496 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  31.71 
 
 		 567 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  36.54 
 
 		 522 aa  43.9  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0154  site-specific DNA-methyltransferase, type I modification  41.46 
 
 		 234 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 510 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  33.87 
 
 		 544 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  45.24 
 
 		 538 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  31.03 
 
 		 849 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  36.96 
 
 		 532 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  31.58 
 
 		 568 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  38.64 
 
 		 527 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  32.73 
 
 		 574 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  44.74 
 
 		 515 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  43.59 
 
 		 633 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.31 
 
 		 587 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  38 
 
 		 567 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  42.22 
 
 		 527 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.88 
 
 		 497 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  38.46 
 
 		 535 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  46.15 
 
 		 517 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  34.62 
 
 		 528 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  32.79 
 
 		 499 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  41.3 
 
 		 523 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  27.88 
 
 		 520 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  44.19 
 
 		 510 aa  42.4  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3715  type I restriction-modification system, M subunit  26.09 
 
 		 547 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  51.61 
 
 		 824 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  37.78 
 
 		 569 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  31.82 
 
 		 537 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  38.46 
 
 		 498 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  32.05 
 
 		 504 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  35.9 
 
 		 501 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  34.09 
 
 		 544 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  33.9 
 
 		 499 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  36.73 
 
 		 525 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  36.73 
 
 		 525 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  28.85 
 
 		 540 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  37.21 
 
 		 505 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>